近日,植物保护学院彩万志、李虎、段元格团队在《细胞和分子生命科学》(Cellular and Molecular Life Sciences)在线发表了题为《首个半翅目昆虫九香虫的A-to-I RNA编辑图谱揭示早期分化昆虫类群中存在大量重编码及内含子编辑位点》的研究论文。该研究以重要药用昆虫九香虫Coridius chinensis为研究材料,在半翅目昆虫中首次...
2023年7月19日,2023年7月19日,华侨大学医学院基因组学研究所和厦门大学生科院合作,Philipp Kapranov教授、曹慧芬博士团队在线上发表了题为“Lessons from discovery of true ADAR RNA editing sites in a human cell line”的文章,发现预测RNA编辑位点的方法具有很高的假阳性,因此基于这些方法公布的A-to-I数据库...
2.1 肌苷的特征提取研究 如图1所示,作者设计了包含肌苷(I)的多种序列,进行体外合成后作为仪器测序的来源进行测序,对比得到肌苷参与时电信号的变化形况得到了以下结论:1.每个event中5-mer的第二个位置对离子电流差异的贡献最大;2.肌苷的信号水平特征表现最多 与A和G不同。具体而言,虽然肌苷的事件均值和标准差介于...
近期的研究发现在人类转录组中存在高达百万计的A-to-I RNA编辑位点(Bazak et al., Genome Res 2014)【1】,主要存在于基因非编码区的重复序列上,如内含子和非翻译区域 (untranslated regions, UTRs)的Alu序列。虽然一些A-to-I RNA编辑事件可以通过影响转录本的编码、折叠、剪接以及出核,在癌症的发生和发...
人类免疫功能相关的基因在人类进化中受到强烈的平衡选择(增加遗传多样性)。鉴于RNA编辑SNP与自身免疫疾病的紧密联系和RNA编辑增加遗传多样性的作用机制,研究组提出了A-to-I RNA编辑受到平衡选择作用的科学假设。 为了验证上述的科学假设,研究组利用群体遗传学中新生等位基因频谱分析方法进行分析,发现A-to-I RNA编辑SNP...
腺苷-肌苷(adenosine-to-inosine,A-to-I)RNA编辑是一种重要的转录后修饰,由腺苷脱氨酶(adenosine deaminase acting on RNA enzymes,ADARs)催化,通过改变RNA分子中的特定核苷酸使转录组多样化[1]。A-to-I编辑的失调在自身免疫性疾病、心血管疾病以及癌症中发挥重要作用[2]。已有研究全面、系统地解析了多种癌症相关...
腺苷到肌苷(A-to-I)RNA编辑是一种重要的转录后修饰,也是人类细胞中最普遍的RNA编辑方式之一,其在编码区和非编码区都会发生,极大地丰富了转录组的多样性。编码区RNA编辑会直接影响蛋白质功能,非编码区RNA编辑可通过影响选择性剪接或RNA稳定性来影响基因表达。此外,RNA编辑还会影响微小RNA的成熟,导致RNA编辑和RNA干扰...
外邀讲座 | ADAR和A-to- I RNA编辑, 视频播放量 1315、弹幕量 0、点赞数 16、投硬币枚数 4、收藏人数 56、转发人数 24, 视频作者 诺唯赞, 作者简介 离5万粉丝还有亿点点的科研搭子 官网:https://www.vazyme.com/ TEL:400-600-9335 ,相关视频:RNA提取与纯化,外邀讲座 |
由ADAR(adenosine deaminase acting on RNA)蛋白介导的腺嘌呤到次黄嘌呤(A-to-I)的RNA编辑是后生动物中广泛存在的转录后修饰。由于I会被识别为G,因此A-to-I RNA编辑在不改变基因组序列的情况下,时空特异性地增加了转录组和蛋白组的多样性。陆剑课题组之前的工作已经报道了在果蝇中存在大量改变氨基酸的非同义RNA...
A-to-I编辑是一种通过脱氨作用将腺苷转换为肌苷的RNA分子修饰,是在哺乳动物中普遍存在的一种共转录和...