2.1 肌苷的特征提取研究 如图1所示,作者设计了包含肌苷(I)的多种序列,进行体外合成后作为仪器测序的来源进行测序,对比得到肌苷参与时电信号的变化形况得到了以下结论:1.每个event中5-mer的第二个位置对离子电流差异的贡献最大;2.肌苷的信号水平特征表现最多 与A和G不同。具体而言,虽然肌苷的事件均值和标准差介于...
近日，植物保护学院彩万志、李虎、段元格团队在《细胞和分子生命科学》（Cellular and Molecular Life Sciences）在线发表了题为《首个半翅目昆虫九香虫的A-to-I RNA编辑图谱揭示早期分化昆虫类群中存在大量重编码及内含子编辑位点》的研究论文。该研究以重要药用昆虫九香虫Coridius chinensis为研究材料，在半翅目昆虫中首次...
常见的RNA编辑类型包括腺苷脱氨基反应(A-to-I编辑)、胞苷脱氨基反应(C-to-U编辑)等。其中,A-to-I编辑是最为广泛研究的一种,也是RNA编辑研究中的重要焦点。 A-to-I编辑主要是通过一种叫做ADAR(腺苷脱氨基酶)的酶家族实现的。ADAR酶能够识别RNA中的腺苷(A)并将其转变为肌苷(I)。这一过程对于细胞的正常功能...
m6A修饰与A-to-I编辑这两种A上的RNA表观修饰在催化原理和发生位置上存在着很大的不同：m6A主要由甲基化酶复合体 (主要为METTL3和METTL14) 催化发生，并由去甲基化酶 (主要为FTO和ALKBH5) 可逆调节去甲基，其主要发生在单链RNA的A碱基上；而A-to-I 编辑主要由腺苷脱氧酶家族（adenosine deaminase acting on ...
人类免疫功能相关的基因在人类进化中受到强烈的平衡选择(增加遗传多样性)。鉴于RNA编辑SNP与自身免疫疾病的紧密联系和RNA编辑增加遗传多样性的作用机制,研究组提出了A-to-I RNA编辑受到平衡选择作用的科学假设。 为了验证上述的科学假设,研究组利用群体遗传学中新生等位基因频谱分析方法进行分析,发现A-to-I RNA编辑SNP...
2021年5月17日,北京大学生命科学学院陆剑课题组在《WIREs RNA》上发表了题为“Evolutionary driving forces of A-to-I editing in metazoans”的综述论文。 由ADAR(adenosine deaminase acting on RNA)蛋白介导的腺嘌呤到次黄嘌呤(A...
由ADAR(adenosine deaminase acting on RNA)蛋白介导的腺嘌呤到次黄嘌呤(A-to-I)的RNA编辑是后生动物中广泛存在的转录后修饰。由于I会被识别为G,因此A-to-I RNA编辑在不改变基因组序列的情况下,时空特异性地增加了转录组和蛋白组的多样性。陆剑课题组之前的工作已经报道了在果蝇中存在大量改变氨基酸的非同义RNA...
m6A修饰与A-to-I编辑这两种A上的RNA表观修饰在催化原理和发生位置上存在着很大的不同:m6A主要由甲基化酶复合体 (主要为METTL3和METTL14) 催化发生,并由去甲基化酶 (主要为FTO和ALKBH5) 可逆调节去甲基,其主要发生在单链RNA的A碱基上;而A-to-I 编辑主要由腺苷脱氧酶家族(adenosine deaminase acting on RNA,...
2023年7月19日,2023年7月19日,华侨大学医学院基因组学研究所和厦门大学生科院合作,Philipp Kapranov教授、曹慧芬博士团队在线上发表了题为“Lessons from discovery of true ADAR RNA editing sites in a human cell line”的文章,发现预测RNA编辑位点的方法具有很高的假阳性,因此基于这些方法公布的A-to-I数据库...
由ADAR(adenosine deaminase acting on RNA)蛋白介导的腺嘌呤到次黄嘌呤(A-to-I)的RNA编辑是后生动物中广泛存在的转录后修饰。由于I会被识别为G,因此A-to-I RNA编辑在不改变基因组序列的情况下,时空特异性地增加了转录组和蛋白组的多样性。陆剑课题组之前的工作已经报道了在果蝇中存在大量改变氨基酸的非同义RNA...