真核生物的复制起点称为自主复制序列(ARS),其中包含一个保守的ARS共识序列ACS。ORC通过AAA +域的起始蛋白特异性基序(ISM)与DNA的磷酸核糖骨架结合,WH域通过一个进入DNA大沟的β-发夹motif结合DNA。这些作用在DNA离开ORC的中央通道时使其弯曲,有助于解旋酶Mcm2-7的装载。在DNA复制过程中解开双螺旋结构的酶称...
CENP-C与CENP-A的C末端、组蛋白H2A和H2B互作;而CENP-N结合CENP-ANuc的L1 loop及临近DNA回转。α-卫星重复中与CENP-B互作的17bp B-box基序是唯一可被中心体相关蛋白特异识别的DNA序列。 在出芽酵母中,一个动粒复合体仅与含有单一CENP...
拟南芥TIR1/AFBs家族有6个成员,具有保守的蛋白结构域:N端为F-box基序,中间大部分为富含亮氨酸的重复序列(Leucine rich repeats, LRR),C末端有一小段序列没有注释任何结构域。该研究根据已知线索进行合理推测,并结合序列分析,在TIR1/AFBs家族的C末端发现存在一个保守的腺苷酸环化酶核心基序。腺苷酸环化酶...
从图1A中可以看到,10个随机选择的结合位点所在启动子均能驱动报告基因的表达。以不同亲和力的结合片段的MtrA结合盒(binding box)替换对fas结合片段的结合盒,报告基因的表达水平发生显著变化 (图1B)。上述结果表明,本研究鉴定的结合片...
对已 有的 4CL 氨基酸序列比对分析表明,在所有已知的 4CL 氨基酸序列中存在保守的肽基序(motif):AMP 结合功能域(Motif I)和 Box II(Motif II).Motif I 作 为底物结合区域(SBP)参与了底物的识别.SBP 的 空间大小决定了 4CL 能否与羟基肉桂酸衍生物结合. Motif II 直接参与催化反应,同时与稳定蛋白质的活 ...
在人类rRNA或tRNA中形成ac4C需要另外两个蛋白质:第一个是box C/D snoRNA U13,它对18S rRNA乙酰化至关重要,主要通过及时的pre-rRNA折叠来实现。另一个是含有THUMP结构域1蛋白(THUMPD1)的特异性RNA接头蛋白,具有可以与NAT10互作并协同参与tRNA乙酰化的RNA结合基序(图2、3、5和表1)。
在人类rRNA或tRNA中形成ac4C需要另外两个蛋白质:第一个是box C/D snoRNA U13,它对18S rRNA乙酰化至关重要,主要通过及时的pre-rRNA折叠来实现。另一个是含有THUMP结构域1蛋白(THUMPD1)的特异性RNA接头蛋白,具有可以与NAT10互作并协同参与tRNA乙酰化的RNA结合基序(图2、3、5和表1)。
多个end motifs 频率组间差异箱线图S1:Box-plot analysis of plasma DNA end motifs between HCC and non-HCC groups showed that there were a number of motifs exhibiting the significant differences between these groups 根据end motifs计算Shannon熵 ...
华中农业大学张俊红课题组于Plant Biotechnology Journal(IF:8.154)上发表了一篇题为“miR156a‐targeted SBP‐Box transcription factor SlSPL13 regulates inflorescence morphogenesis by directly activating SFT in tomato”的研究文献,该文献揭示了miR156a的SBP-Box转录因子SlSPL13通过直接激活番茄中的 SFT调节花序形态...