RY-repeat、G-box和ACGT-box在MBL基因启动子中的调控作用.pdf,摘要 根据生物信息学分析结果,对启动子序列进行系列缺失、构建四个缺失植物表达 载体,通过农杆菌介导将戬生四个表达载体转化遗传模式植物拟南芥,并慰转基嚣撒 南芥进行了连续三代筛选,获得了纯合子。并与已
除了基因本体,我们还包括来自KEGG Reactome和WikiPathways的路径;miRNA靶点来自miRTarBase,调控基序匹配来自TRANSFAC;来自人蛋白图谱的组织特异性;来自CORUM的蛋白质复合物和来自human Phenotype Ontology的人类疾病表型。g:GOSt支持近500种生物,并接受数百种标识符类型。 我们点击 random example 可以看到 Query 里面出现基因...
中国科学院微生物研究所胡松年团队发表研究论文，开发了一款基于序列相似性和多个基序间位置保守性的多基序扫描工具multiMotif (https://github.com/SainanLuo/multiMotif)，通过采用滑动窗口算法，提供了与传统PWM矩阵算法不同的新视角。Toward a universal approach for predicting variant pathogenicity in diverse disease...
总结已报道的G4相关蛋白的氨基酸序列规律, 根 据该规律预测新的G4相关蛋白, 通过对大量G4结合蛋 白的分析, 研究人员发现多个参与到G4识别中的关键 结构域. 如DHX36与G4的晶体结构表明, DHX36特异 性基序(DSM)和C端类OB折叠域对DHX36识别G4结构 起关键作用[68]. 此外, 富含精氨酸与甘氨酸的RGG结构 域...
18.项目16或17所述的生物传感器系统,其中所述pm靶向部分包括异戊二烯化基序。 19.项目16所述的生物传感器系统,其中所述异戊二烯化基序是人kras剪接变体b的异戊二烯化基序。 20.项目19所述的生物传感器系统,其中所述pm靶向部分包括氨基酸序列kkkkkksktkcvim(seqidno:37)。
从功能特性,真核基因顺式作用元件分为:启动子增强子沉默子112 启动子是原核操纵子中启动序列的同义语。 真核基因启动子是RNA聚合酶结合位点周围的一组转录控制组件,每一组件含720 bp的DNA序列。启动子包括至少一个转录起始点以及一个以上的机能组件。 55、113i)TATA box位于转录起始位点上游25-30bp(-25-30)...
9个氨基酸组成的特殊序列,称为破坏框(destruc— tionbox,RXXLGXIXN),主要参与由泛素介导的周 期蛋白A和B的降解。G。期周期蛋白c端含有一 段PEsT序列,与G。期周期蛋白的更新有关。 1 周期蛋白G家族简介 周期蛋白G家族是近年来发现的一类周期蛋 白,该家族包括3个成员,分别为:周期蛋白Gl,周 ...
突状细胞(pDC)中的DHX36通过DEAH盒基序特异性识别和结合富含G的DNA (CpG-A),以引发相关细胞因子应答,因此DHX36也参与抗病毒免疫。同时DHX36 还被认为是HeLa细胞裂解物中G-四链体(简称G4)解旋活性的主要来源。已有大量 的体外实验数据证实了DHX36也具有解旋G4结构的活性。
(Pol δ、Pol ε、Pol η、Pol κ、FEN1、LIG1等)、解旋酶(WRN、BLM、RECQ5等)、DNA修复蛋白(MSH3、MSH6、XPG、FANCM等)、表观遗传因子(CAF-1、DNMT1、p300、HDAC1等)及参与细胞周期调控、凋亡等过程的一些蛋白分子,它们都是通过自身保守的PIP box(PCNA-interacting protein box)或...
Stage2B阶段:利用GSEA对序列基因列表进行通路富集分析(步骤6B) Stage 2B:pathway enrichment analysis of a ranked gene list using GSEA(Step 6B) 在GSEA软件(Step 6B) (Box 4)中对一个排序的基因列表进行路径富集分析,GSEA是一种无阈值的方法,它根据所有基因的差异表达等级或其他得分进行分析,不需要事先进...