hmC进一步氧化为fC或caC,被专用糖基化酶去除; c. DNA烷基化损伤产物O6-甲基鸟嘌呤通过将O6-甲基转移到甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(MGMT)蛋白的半胱氨酸残基上的SN2而直接还原为鸟嘌呤; d. DNA中代表性N-烷基化碱基(N3甲基胞嘧啶、N6甲基腺嘌呤)被AlkB
基于亲和富集的方法依赖于将含有hmC的短DNA片段(通常为200-500 bp)选择性结合到hmC特异性抗体,其他hmC结合蛋白或hmC与报告基团的衍生化,从而允许从其余DNA中物理提取,然后使用定量PCR、DNA微阵列或测序进行分析。片段化基因组DNA长度决定了所有基于富集方法的分辨率极限。类似于甲基化DNA免疫沉淀(MeDIP),针对hmC开发了...
基于亲和富集的方法依赖于将含有hmC的短DNA片段(通常为200-500 bp)选择性结合到hmC特异性抗体,其他hmC结合蛋白或hmC与报告基团的衍生化,从而允许从其余DNA中物理提取,然后使用定量PCR、DNA微阵列或测序进行分析。片段化基因组DNA长度决定了所有基于富集方法的分辨率极限。类似于甲基化DNA免疫沉淀(MeDIP),针对hmC开发了...
(3) 5hmC修饰和相关的表观遗传学修饰在DNA修复、复制、转录和细胞分化中发挥的主要调控作用。 (4) 5-羟甲基胞嘧啶作为疾病标志物和治疗靶点的潜在效用。 1、Introduction 基因组的关键功能是存储、复制和传递编码的遗传信息。通过使用一种(表观)遗传“书签”系统,可以有意义且及时的read不同类型细胞中数十亿(M)...
(3) 5hmC修饰和相关的表观遗传学修饰在DNA修复、复制、转录和细胞分化中发挥的主要调控作用。 (4) 5-羟甲基胞嘧啶作为疾病标志物和治疗靶点的潜在效用。 1、Introduction 基因组的关键功能是存储、复制和传递编码的遗传信息。通过使用一种(表观)遗传“书签”系统,可以有意义且及时的read不同类型细胞中数十亿(M)...
C5 Mtase酶通过将磺基结合的甲基SN2转移到共价活化的靶胞嘧啶残基上进行胞嘧啶甲基化;哺乳动物TET双加氧酶氧化DNA中的mC产生化学稳定的hmC,hmC进一步氧化为fC或caC,被专用糖基化酶去除;DNA烷基化损伤产物O6-甲基鸟嘌呤通过将O6-甲基转移到甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(MGMT)蛋白的半胱氨酸残基上的SN2而直接还原为鸟嘌...
观察到不同组织间的5hmC含量有显著差异。检测到5hmC占总核苷酸比率高的是在脑、肝,肾和结肠癌组织(0.40-0.65%),相对较低的是肺(0.18%)和极低的心脏、乳腺及胎盘(0.05-0.06%)。与正常大肠组织(0.46 - 0.57%)相比,大肠癌组织的5hmC丰度显著降低(0.02-0.06%)。上述结果首次显示, 在人体组织中5-hmC分布是...
5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)在DNA中的存在最初是在某些噬菌体中观察到的。在T-even噬菌体中,5-羟甲基胞嘧啶在DNA合成过程中被掺入基因组中,随后由噬菌体α-和β-葡萄糖基转移酶修饰,产生含有5-葡糖基氧基甲基胞嘧啶(glc-hmC)残基的高度糖基化DNA。这种DNA对宿主限制性内切酶的切割具有抗性...
5-羟甲基胞嘧啶检测方法表观遗传修饰是指在不改变DNA序列的情况下,基因表达发生的可遗传变化.5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)是继5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)后发现的表观遗传修饰,被称为"第六种碱基".5hmC广泛分布于哺乳动物的组织和细胞中,它的异常表达与肿瘤发生,发育性疾病和神经系统...