5-甲基胞嘧啶(5mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)是哺乳动物基因组中最丰富的两个表观遗传标记,已经证明,这些双重表观遗传标志比单个标记更能准确预测癌症的复发和存活。然而,由于5mC和5hmC的结构相似且低表达,区分和量化这两种甲基化修饰具有挑战性。 西南大学卓颖和钟霞使用十个十一位易位家族的双加氧酶(TET)通过特...
本发明属于表观遗传学技术领域,具体涉及一种区分DNA中5甲基化胞嘧啶和5羟甲基化胞嘧啶的方法.该方法基于APOBEC3A对5mC和5hmC脱氨基转化的差异性,直接将被检测位点作为特异性引物的3'末端,qPCR扩增后不同的甲基化修饰会产生不同的扩增Ct值,根据酶转化产物和阴性对照之间的Ct值差异,从而快速区分被检测位点的修饰是...
6.一种区分DNA中5-甲基化胞嘧啶和5-羟甲基化胞嘧啶方法, 其特征在于, 包括以下步骤:(1)用β-葡萄糖基转移酶处理待检测DNA, 将待检测DNA中所有5-羟甲基化胞嘧啶进行糖基化修饰;(2)采用权利要求1-5任一项所述DNA脱氨基转化的方法, 以APOBEC3A酶液处理步骤(1)中糖基化产物, 将DNA中的胞嘧啶转化为尿嘧啶...
本发明属于表观遗传学技术领域,具体涉及一种区分DNA中5‑甲基化胞嘧啶和5‑羟甲基化胞嘧啶的方法。该方法基于APOBEC3A对5‑mC和5‑hmC脱氨基转化的差异性,直接将被检测位点作为特异性引物的3’末端,qPCR扩增后不同的甲基化修饰会产生不同的扩增Ct值,根据酶转化产物和阴性对照之间的Ct值差异,从而快速区分被...
近日,中国科学院北京基因组研究所慈维敏课题组,刘江课题组和北京大学第一医院周利群课题组合作,深入探讨了5m C(5-甲基胞嘧啶)和5hm C(5-羟甲基胞嘧啶)在透明肾细胞癌中的重编程变化模式和规律,发现5hm C是肾癌潜在的预后标志物,同时5hm C在肾癌发生过程中可能的驱动作用及其分子机制,寻找到一种潜在的肿瘤治疗...
5-羟甲基胞嘧啶(DNA 5-hydroxymethylcytosine, 5hmC)修饰被认为与基因转录有关,并经常被用作研究哺乳动物发育和人类疾病过程中DNA甲基化转化的动态标记。然而,在不同的人类组织类型中缺乏全基因组5hmC谱,这阻碍了对5hmC如何涉及转录活性和组织特异性的概括结论。为了满足这一需求,我们描述了5hmC组织图谱的开发,通过...
基于等温扩增的5-甲基胞嘧啶可视化检测 DNA甲基化是重要的基因修饰方法之一,也是目前研究较为深入的一种表观遗传学调控机制.特定区域DNA甲基化水平的高低与细胞癌变过程,染色体调节,转录调节等密切相关.在此... 赖涵,刘文婷,翁小成,... - 中国化学会学术年会 被引量: 0发表: 2014年 一种检测5-羟甲基胞嘧啶的...
以及疾病中发挥重要作用。研究发现,TET蛋自家族可催化5·甲基胞嘧啶(5me)羟基化的酶活性, 从而生成5.羟甲基胞嘧啶(5hme)。n、T蛋白的这种催化作用可将DNA同一位点上的C、5me、5hme 保持动态平衡。rET家族蛋白和5hme与众多疾病的发生、发展有关,尤其是与肿瘤疾病的关系使人 ...
摘要:大脑的发育和神经系统疾病的发生发展是极其复杂的过程,涉及多种因素.大量研究证实,表观遗传调控系统,如组蛋白甲基化、组蛋白乙酰化和DNA甲基化,是其中一类重要的调控因素.近年来研究发现,DNA去甲基化中间产物5-羟甲基胞嘧啶(5hm C)是一种新的表观遗传标记形式,且在神经元内呈现非常高的水平.这暗示5hm C可...
5羟甲基胞嘧啶(5hmC)信号是5-甲基胞嘧啶(5mC)被十一种易位酶氧化的产物,普遍反映了早期肿瘤发生中基因表达的激活状态。最近的研究表明,肝癌患者的cfDNA 5hmC信号是可以比蛋白生物标志物AFP提供更高的临床早期肝癌诊断敏感性。 研究途径:我们对165位健康志愿者,62位肝硬化(LC)患者和135位HCC患者收集的cfDNA样本进行...