5-甲基胞嘧啶(5mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)是哺乳动物基因组中最丰富的两个表观遗传标记,已经证明,这些双重表观遗传标志比单个标记更能准确预测癌症的复发和存活。然而,由于5mC和5hmC的结构相似且低表达,区分和量化这两种甲基化修饰具有挑战性。 西南大学卓颖和钟霞使用十个十一位易位家族的双加氧酶(TET)通过特...
TET 蛋白可以介导 5mC 迭代氧化为 5- 羟甲基胞嘧啶 (5hmC)，5- 甲酰基胞嘧啶 (5fC) 和 5- 羧胞嘧啶 (5caC)。氧化的 5mC 衍生物不能用作 DNMT1 的底物，在复制的过程中被动脱甲基作用而丢失，胸腺嘧啶DNA糖基化酶 (TDG) 介导的 5fC 和 5caC 切除的复制依赖稀释，再加上碱基切除修复 (BER)，...
通过TET家族的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶的作用,mC可以被氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,简称5hmC),甚至进一步氧化为5-甲酰基胞嘧啶(fC)和5-羧基胞嘧啶(caC)。这些发现揭示了一种长期难以捉摸的主动DNA去甲基化机制,并推动了哺乳动物表观遗传学调控领域的研究浪潮。本综述对DNA中hmC形成和转化的...
在哺乳动物基因组中,CpG二核苷酸中的胞嘧啶(C)在嘧啶环的5位发生甲基化(mC)。通过TET家族的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶的作用,mC可以被氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,简称5hmC),甚至进一步氧化为5-甲酰基胞嘧啶(fC)和5-羧基胞嘧啶(caC)。这些发现揭示了一种长期难以捉摸的主动DNA去甲基化...
在哺乳动物基因组中,CpG二核苷酸中的胞嘧啶(C)在嘧啶环的5位发生甲基化(mC)。通过TET家族的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶的作用,mC可以被氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,简称5hmC),甚至进一步氧化为5-甲酰基胞嘧啶(fC)和5-羧基胞嘧啶(caC)。这些发现揭示了一种长期难以捉摸的主动DNA去甲基化...
在哺乳动物基因组中,CpG二核苷酸中的胞嘧啶(C)在嘧啶环的5位发生甲基化(mC)。通过TET家族的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶的作用,mC可以被氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,简称5hmC),甚至进一步氧化为5-甲酰基胞嘧啶(fC)和5-羧基胞嘧啶(caC)。这些发现揭示了一种长期难以捉摸的主动DNA去甲基化...
在哺乳动物基因组中,CpG二核苷酸中的胞嘧啶(C)在嘧啶环的5位发生甲基化(mC)。通过TET家族的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶的作用,mC可以被氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,简称5hmC),甚至进一步氧化为5-甲酰基胞嘧啶(fC)和5-羧基胞嘧啶(caC)。这些发现揭示了一种长期难以捉摸的主动DNA去甲基化...
在哺乳动物基因组中,CpG二核苷酸中的胞嘧啶(C)在嘧啶环的5位发生甲基化(mC)。通过TET家族的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶的作用,mC可以被氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,简称5hmC),甚至进一步氧化为5-甲酰基胞嘧啶(fC)和5-羧基胞嘧啶(caC)。这些发现揭示了一种长期难以捉摸的主动DNA去甲基化...
本发明属于表观遗传学技术领域,具体涉及一种区分DNA中5甲基化胞嘧啶和5羟甲基化胞嘧啶的方法.该方法基于APOBEC3A对5mC和5hmC脱氨基转化的差异性,直接将被检测位点作为特异性引物的3'末端,qPCR扩增后不同的甲基化修饰会产生不同的扩增Ct值,根据酶转化产物和阴性对照之间的Ct值差异,从而快速区分被检测位点的修饰是...