1、C技术 3C（一对一）4C（一对多）5C（多对多）Hi-C（全部互作）2、基于免疫沉淀技术 ChIP-loop ...
在4C的基础上，5C技术添加了标签，能检测多种点之间的相互作用，进一步增强了检测能力。Hi-C技术则是通过甲醛交联、限制酶切割、末端补平添加生物素、平末端连接、超声破碎、生物素富集、建立库并进行测序，整个过程中没有特异性引物。Hi-C技术凭借高通量测序，展示了整个染色体中的全部相互作用关系。ChIA...
4C 技术称环状染色质构象捕获 (circular chromosome conformation capture) 或芯片染色质构象捕获 (chromosome conformation capture-on-chip) .4C 技术的基本原理可概括为:福尔马林瞬时固定细胞核内的染色质,用过量的限制性内切酶将染色质 蛋白质交联物酶切消化,在 DNA 浓度极低、连接酶浓度极高的条件下将消化物用连...
5C技术是在4C的技术上，加了个tag标签，导致可以检测many-to-many的相互作用。没啥说的。 Hi-C的基本步骤是，甲醛交联，限制酶切，末端补平加biotin，平末端连接，超声破碎，biotin富集，建库测序。整个过程是没有特异性引物存在的。而且依靠高通量的测序技术，Hi-C可以展现出，整个染色体all-to-all的...
在过去10年中,染色体构象捕获(chromosome conformation capture 3C)技术及其该技术的拓展技术(4C,5C,Hi-C,ChIA-PET),使人们能够以超强的分辨率和高通量测序分析细胞核内的三维立体结构 3C技术:走向三维(3D)基因组学的基础 Fig1 1.交联:用甲醛交联染色质,固定蛋白与DNA,使染色质保持三维结构。
在过去10年中,染色体构象捕获(chromosome conformation capture 3C)技术及其该技术的拓展技术(4C,5C,Hi-C,ChIA-PET),使人们能够以超强的分辨率和高通量测序分析细胞核内的三维立体结构 3C技术:走向三维(3D)基因组学的基础 Fig1 1.交联:用甲醛交联染色质,固定蛋白与DNA,使染色质保持三维结构。
3C,4C,5C都是基于最原始的junction reads, 不同之处就在于不同引物设计策略导致的通量的差异。 Hi-C在原始3C基础上有所变化,junction reads产生过程中添加生物素标记,然后采用抗体富集带有标记的junction reads, 再构建普通的测序文库,进行高通量测序。没有了针对目标区域设计引物的限制,再结合测序的高通量特点, 使...
3C,4C,5C都是基于最原始的junction reads, 不同之处就在于不同引物设计策略导致的通量的差异。 Hi-C在原始3C基础上有所变化,junction reads产生过程中添加生物素标记,然后采用抗体富集带有标记的junction reads, 再构建普通的测序文库,进行高通量测序。没有了针对目标区域设计引物的限制,再结合测序的高通量特点, 使...
3C,4C,5C都是基于最原始的junction reads, 不同之处就在于不同引物设计策略导致的通量的差异。 Hi-C在原始3C基础上有所变化,junction reads产生过程中添加生物素标记,然后采用抗体富集带有标记的junction reads, 再构建普通的测序文库,进行高通量测序。没有了针对目标区域设计引物的限制,再结合测序的高通量特点, 使...
4C 技术称环状染色质构象捕获 (circular chromosome conformation capture) 或芯片染色质构象捕获 (chromosome conformation capture-on-chip) .4C 技术的基本原理可概括为:福尔马林瞬时固定细胞核内的染色质,用过量的限制性内切酶将染色质 蛋白质交联物酶切消化,在 DNA 浓度极低、连接酶浓度极高的条件下将消化物用连...