1、C技术 3C（一对一）4C（一对多）5C（多对多）Hi-C（全部互作）2、基于免疫沉淀技术 ChIP-loop ...
5C实际上是 多重3C需要设计大量的引物,无法真正进行全基因组筛选。 Hi-C 技术也是基于 3C 原理发展而来,主要步骤为:用福尔马林交联细胞内与蛋白质相互作用的染色体,限制性酶切进行消化,再将缺口进行补平(dCTP 进行生物素标记),连接酶进行连接,将样本进行超声破碎,随后用生物素亲和层析将片段沉淀,加上接头进行深度...
在4C的基础上，5C技术添加了标签，能检测多种点之间的相互作用，进一步增强了检测能力。Hi-C技术则是通过甲醛交联、限制酶切割、末端补平添加生物素、平末端连接、超声破碎、生物素富集、建立库并进行测序，整个过程中没有特异性引物。Hi-C技术凭借高通量测序，展示了整个染色体中的全部相互作用关系。ChIA...
5C技术是在4C的技术上，加了个tag标签，导致可以检测many-to-many的相互作用。没啥说的。 Hi-C的基本步骤是，甲醛交联，限制酶切，末端补平加biotin，平末端连接，超声破碎，biotin富集，建库测序。整个过程是没有特异性引物存在的。而且依靠高通量的测序技术，Hi-C可以展现出，整个染色体all-to-all的...
在过去10年中,染色体构象捕获(chromosome conformation capture 3C)技术及其该技术的拓展技术(4C,5C,Hi-C,ChIA-PET),使人们能够以超强的分辨率和高通量测序分析细胞核内的三维立体结构 3C技术:走向三维(3D)基因组学的基础 Fig1 1.交联:用甲醛交联染色质,固定蛋白与DNA,使染色质保持三维结构。
3C,4C,5C都是基于最原始的junction reads, 不同之处就在于不同引物设计策略导致的通量的差异。 Hi-C在原始3C基础上有所变化,junction reads产生过程中添加生物素标记,然后采用抗体富集带有标记的junction reads, 再构建普通的测序文库,进行高通量测序。没有了针对目标区域设计引物的限制,再结合测序的高通量特点, 使...
3C,4C,5C都是基于最原始的junction reads, 不同之处就在于不同引物设计策略导致的通量的差异。 Hi-C在原始3C基础上有所变化,junction reads产生过程中添加生物素标记,然后采用抗体富集带有标记的junction reads, 再构建普通的测序文库,进行高通量测序。没有了针对目标区域设计引物的限制,再结合测序的高通量特点, 使...
3C最早，只能做某一些特殊点的，4C把范围扩大了一些，到HiC，可以给出整个染色体上所有loci之间的相互...
上一个我觉得我见过讲的最清楚的图。
5C实际上是 多重3C需要设计大量的引物,无法真正进行全基因组筛选。 Hi-C 技术也是基于 3C 原理发展而来,主要步骤为:用福尔马林交联细胞内与蛋白质相互作用的染色体,限制性酶切进行消化,再将缺口进行补平(dCTP 进行生物素标记),连接酶进行连接,将样本进行超声破碎,随后用生物素亲和层析将片段沉淀,加上接头进行深度...