4C(一对多)染色体构象捕获芯片(Chromosome conformation capture-on-chip,4C ),可以捕获一个基因区域...
这就衍生出了4C,5C,Hi-C技术。如果我们想知道特定蛋白下的基因互作呢?这就衍生出了ChIP-loop和ChIA-PET 3C (one-vs-one) 主要研究点对点的基因互作 4C (one-vs-all) 主要研究一个特定基因与其所有互作的基因的互作。4C是在3C基础设计了双酶切位点,然后通过成环的形式,保证了只需要设计1对引物,就可以检测1...
这就衍生出了4C,5C,Hi-C技术。如果我们想知道特定蛋白下的基因互作呢?这就衍生出了ChIP-loop和ChIA-PET 3C (one-vs-one) 主要研究点对点的基因互作 4C (one-vs-all) 主要研究一个特定基因与其所有互作的基因的互作。4C是在3C基础设计了双酶切位点,然后通过成环的形式,保证了只需要设计1对引物,就可以检测1...
ChIP-loop是使用特异性抗体捕获蛋白,检测与这个蛋白特异结合的两条DNA,连接两条互作DNA,形成loop,再进行PCR检测。(ChIP+3C) ◆ChIA-PET (all-vs-all) ChIA-PET 是用抗体将目标蛋白捕获下来,然后加入adapter后,再进一步用Hi-C方法得到通过目标蛋白进行相互作用的所有基因(ChIP+adapter+Hi-C) 三、应用案例 应用一...
3C和XXXHiC, ChIA-PET其实都是HiC的子集,区别是,3C对功能来说,算是随机的子集,因为技术水平不够...
上一个我觉得我见过讲的最清楚的图。
5C技术是在4C的技术上,加了个tag标签,导致可以检测many-to-many的相互作用。没啥说的。4.Hi-C Hi...