使用Nm-Mut-seq进行转录组范围2'-O-甲基化的碱基分辨率定量定位(图源自Cell Research)为了确定Nm修饰的化学计量学,作者使用含有Nm-Mut-seq的合成寡核苷酸制备了Nm-Mut-seq文库,这些寡核苷酸的化学计量量不同。在含有100% Nm的探针上的结果显示,RT-41B4在不同序列背景下的Nm位点产生可变突变率,这表明序列背景相关...
比较TAR ES1的模拟物的二维图谱,可以看出,Nm修饰确实产生了化学位移,但是波动不大,说明Nm修饰对GS的二级结构的影响较小。作者推测产生CSP的原因可能有两方面:第一,Nm修饰的残基处原子核周围的电荷环境发生变化从而产生CSP现象,但是...
Direct RNA seq在本研究中作为核心技术手段,对于全面刻画果蝇rRNA的2'-O-甲基化景观、验证修饰酶的功能、排除假阳性干扰以及深入理解C/D box snoRNA介导的甲基化调控机制均起到了决定性作用。 图1 黑腹果蝇rRNANm和C/D box snoRNA的综合图谱 研究结果 1. 黑腹果蝇rRNA上的Nm位点鉴定 本研究通过构建RMS文库,对果...
该工作开发了在全转录组单碱基分辨率检测2'-O-甲基化修饰位点的Nm-REP-seq新技术,并在人、小鼠和果蝇等组织和细胞中系统鉴定mRNA和ncRNA内部及末端的2'-O-甲基化修饰位点。 杨建华教授/屈良鹄教授团队开发了基于核酸外切酶MgR(Mycoplasma genitaliumRNase R)富集2'-O-甲基化修饰RNA和2'-O-甲基化修饰耐受NaIO4氧化...
近期,南开大学校长曹雪涛院士领衔的科研团队发表的论文发现,Nm 甲基化转移酶 FBL 可通过对 mRNA 的 Nm 修饰来促进病毒感染、抑制先天免疫反应。云序生物有幸参与了此项研究中的 2’-O-甲基化修饰测序(Nm-seq )、mRNA 测序以及数据分析。至此,云序生物服务的客户在RNA修饰研究上面即将实现大满贯,在m6A、m5C、m1A...
●近日,我院杨建华教授/屈良鹄教授团队开发了在全转录组单碱基分辨率检测2’-O-甲基化修饰位点的Nm-REP-seq新技术,并在人、小鼠和果蝇等组织和细胞中系统鉴定mRNA和ncRNA内部及末端的2’-O-甲基化修饰位点。团队开发了基于核酸外切酶MgR(Mycoplasma genitalium RNase R)富集2’-O-甲基化修饰RNA和2’-O-甲基化修饰...
Direct RNA seq在本研究中作为核心技术手段,对于全面刻画果蝇rRNA的2'-O-甲基化景观、验证修饰酶的功能、排除假阳性干扰以及深入理解C/D box snoRNA介导的甲基化调控机制均起到了决定性作用。 图1 黑腹果蝇rRNANm和C/D box snoRNA的综合图谱 研究结果
其中,来自Transformers (BERT)的双向编码器表示专注于单词嵌入的语境化,以提取单词的语境和语义。另一方面,转录后2 '-O-甲基化(Nm) RNA修饰在各种细胞任务中具有重要意义,并与许多疾病相关。现有的高通量实验技术需要更长的时间来检测这些变化,探索这些功能过程的成本也更高。在这里,为了更快地深入了解相关的生物学...
1 1 N C CN 111197070 A 权利要求书 1/2 页 1.一种鉴定RNA分子是否在3’末端核苷酸上具有2’-O-甲基化修饰的方法,包括: (1)让所述RNA分子与核糖核酸酶Rnase R接触;以及 (2)检测所述RNA分子是否被降解, 其中,如果所述RNA分子被降解,则表明所述RNA分子在3’末端核苷酸上不具有2’-O-甲 基化修饰。
近日,我院杨建华/屈良鹄教授团队开发了在全转录组单碱基分辨率检测2’-O-甲基化修饰位点的Nm-REP-seq新技术,并在人、小鼠和果蝇等组织和细胞中系统鉴定mRNA和ncRNA内部及末端的2’-O-甲基化修饰位点。团队开发了基于核酸外切酶MgR(Mycoplasma genitaliumRNase R)富集2’-O-甲基化修饰RNA和2’-O-甲基化修饰耐受NaIO...