2'-O-甲基化(Nm)是一种普遍存在于许多细胞RNA中的转录后RNA修饰,在调节真核RNA的物理性质和功能方面起着关键作用。长期以来,由于缺乏有效的定位方法,RNA中Nm修饰的研究一直受到阻碍。 2023年6月15日,芝加哥大学何川、Bryan C. Dickinson及武汉大学赵昌明共同通讯在Cell Research(IF=38)在线发表题为“Nm-Mut-seq...
研究者首先在 VSV 病毒(Vesicular Stomatitis Virus)感染的小鼠巨噬细胞 RAW264.7 和未感染的对照组细胞中进行了mRNA 修饰质谱LC-MS,发现核糖 2’-OH 上发生甲基化修饰的腺嘌呤残基(Am)的比例在病毒感染后显著上升。研究者进而对 VSV 病毒感染的小鼠巨噬细胞及未感染病毒的对照组细胞进行了 mRNA 的 2’-O-甲...
Direct RNA seq在本研究中作为核心技术手段,对于全面刻画果蝇rRNA的2'-O-甲基化景观、验证修饰酶的功能、排除假阳性干扰以及深入理解C/D box snoRNA介导的甲基化调控机制均起到了决定性作用。 图1 黑腹果蝇rRNANm和C/D box snoRNA的综合图谱 研究结果 1. 黑腹果蝇rRNA上的Nm位点鉴定 本研究通过构建RMS文库,对果...
●近日,我院杨建华教授/屈良鹄教授团队开发了在全转录组单碱基分辨率检测2’-O-甲基化修饰位点的Nm-REP-seq新技术,并在人、小鼠和果蝇等组织和细胞中系统鉴定mRNA和ncRNA内部及末端的2’-O-甲基化修饰位点。团队开发了基于核酸外切酶MgR...
检测冠心病患者血清中3′端2′-O-甲基化(2′-O-methylation,2′Ome)修饰的微小RNA-486-5p(miR-486-5p)水平的变化,评估其作为辅助诊断冠心病生物标志物的临床应用价值。 方法 选取2021年1月至2022年12月于东部战区总医院确诊的...
本发明提供了一种鉴定RNA分子是否在核苷酸上具有2‑O‑甲基化修饰的方法,其包括(1)让所述RNA分子与核糖核酸酶RnaseR接触;以及(2)检测所述RNA分子是否被降解或降解后终止水解的位置。其中,如果所述RNA分子被降解,则表明所述RNA分子在3末端核苷酸上不具有2‑O‑甲基化修饰;而多个随机打断后的片段均终止水解...
为了鉴定由SNORD104介导的2'O-甲基化调控的潜在靶基因,作者在对照和SNORD104过表达细胞中进行了NM-seq。如图4C所示,2ʹ-O-甲基化在928个甲基化位点(671个RNA)上调(倍数变化≥2)。据报道,小核仁RNA通常通过互补碱基配对来指导靶RNA的修饰。因此,作者将具有上调的 2'O-甲基化水平的 RNA 和具有 SNORD104 互...
本发明涉及鉴定rna分子是否具有2’-o-甲基化修饰以及确定2’-o-甲基化修饰位点的方法,还涉及这些方法在确定疾病诊断靶点以及确定受试者是否具有2’-o-甲基化修饰相关疾病方面的应用。背景技术::自从50多年前第一个假尿嘧啶核苷被发现,到目前为止,在生物界己经鉴定出100多种不同的rna修饰,这些修饰主要发生在新...
新冠病毒(SARS-CoV-2)的 2′-O - 核糖甲基化修饰在其感染过程中起着关键作用。病毒通过修饰其 RNA 的 2′-OH,来逃避宿主的免疫识别并保护 mRNA 不被降解。这种修饰是由 nsp16 与 nsp10 形成的复合物共同完成的,该复合物能将 mRNA 帽从 Cap-0(m7GpppA)转变为 Cap-1(m7GpppAm),从而避免被宿主的 MDA...
本发明所述的核糖核酸酶能够快速鉴定2’‑O‑甲基化修饰的RNA,能够从2’‑O‑甲基化修饰和非2’‑O‑甲基化修饰的RNA混合物中,特异性分离筛选2’‑O‑甲基化修饰的RNA,并进行富集或者纯化。本发明所述的可识别2’‑O‑RNA甲基化修饰的核糖核酸酶R在生命科学研究以及医学检验过程中具有潜在应用...