百度试题 题目1、什么是序列比对,双序列比对,多序列比对 相关知识点: 试题来源: 解析反馈 收藏
多序列比对是对3条以上(包括3条)DNA,RNA或蛋白序列进行比对。基础仍然是双序列比对。 具体就是对多条序列插入空位,是的插入空位后的全局比对结果有相同的长度,并且结果中不能出现一列全部是空位(也就是每条序列的同一个位置都没用字母)。是发现 多条序列的共性, 通常是为了发现 构成同一基因...
生物信息学中的多序列比对算法[1]
序列比对:又叫序列联配,其意义在于核酸、序列比对:又叫序列联配,其意义在于核酸、核酸氨基酸的层次分析序列的相似性,的层次分析序列的相似性氨基酸的层次分析序列的相似性,推测其结构功能及进化上的联系是基因识别、的联系,结构功能及进化上的联系,是基因识别、分子进化、生命起源研究的基础。分子进化、生命起源...
3、 而分析各序列之间的相似性和差异。 两条序列比对的计算复杂度是N2 多序列比对的计算复杂度呈指数增长, 计算量巨大,无法实际应用 1,., (2) k i ik Os (2) kk ON 生物信息学培训班生物信息学培训班 算法原理 动态规划算法 多序列比对 多序列比对的动态规划算法多序列比对的动态规划算法 Sequence 1 Sequ...
多序列比对,进化树分析,motif预测,密码子偏好性分析(2)前言:假如类鼻疽杆菌中发现有一个感兴趣的gene,想查看此gene在各类鼻疽菌株甚至原核生物和真核生物中是否也表达此gene。若表达,各菌株之间序列差异大不大,进而看其保守性,密码子的使用是否有所偏好。以...
一、序列比对(alignment)的概念、目的 比对(联配)将两条或多条(核苷酸或氨基酸)序列排列 在一起,通过一定的算法找出序列之间最大相似性匹配的过程。ATGCATGCATGCATGCATATATATATATATATATGCATGCATGCATGCATGC||| CGATCGATCGATCGATATATATATATGCATATATATGCATGCATGCATGCAT 一、序列比对(alignment)的概念、目的 序列...
多序列比对的编辑和发布 - 1. Jalview的介绍和操作-视频。听TED演讲,看国内、国际名校好课,就在网易公开课
序列比对基础 1 2 3 4 sequencealignment pairwisesequencealignment multiplesequencealignment globalalignment localalignment identity 11 THISISA-SEQUENCE=68.75% THATSEQUENCE16 Similarity -OH THISISA-SEQUENCETHISISASEQUENCE THATSEQUENCETHATSEQUENCE Homology Orthology Paralogy paralogs convergen ...
注:软件默认二级结构展示出的为多重序列比对中的第一个序列,如二者不对应,则需要进一步自定义序列顺序。 而本例子中第一个序列为SOD1_human,与提供的小鼠SOD1三维结构模型不对应,因此需要在Sequences to display处自定义序列顺序。 3. 选择序列相似性描述参数 ...