ITS位于18S和28S rRNA基因之间的小亚基和大亚基之间，包括ITS1、5.8S rRNA基因和ITS2三个部分。ITS序...
微生物多样性测序是一种高通量DNA测序技术,广泛用于分析环境样本中微生物群落的组成和多样性。其中,16S/18S/ITS扩增子测序是一种常用的方法,利用特定的核糖体RNA基因片段(16S rRNA、18S rRNA和内转录间隔区,即ITS)作为标记,进行微生物群落结构的分析。 技术原理 利用聚合酶链式反应(PCR)技术,选择性地扩增特定的目标...
ITS是真菌基因组中的一个高变区域,位于真核生物的核糖体基因组中的18S-5.8S-28S rRNA基因间区域。ITS序列通常包括ITS1和ITS2两个子区域,它们之间由5.8S rRNA序列连接。 18S rRNA是真菌核糖体基因组中的一个保守区域,它在真核生物中广泛存在,用于构建系统发育树和物种鉴定。
基于18S rRNA基因的不同区域序列变化,人们已将其细分为8个可变区(V1-V9,但不包括V6)。 此外,内转录间隔区(ITS)是位于染色体上SSU rRNA与LSU rRNA之间的一段区域。在真核生物中,存在两种类型的ITS:ITS1和ITS2。ITS1位于18S和5.8S之间,而ITS2则位于5.8S和28S之间。 关于ITS的重要性: ITS序列的进化速度非常...
ITS1位于18S和5.8S rRNA之间,而ITS2则位于5.8S和28S rRNA之间。 ITS序列的进化速度相当快,因此展现了丰富的序列多态性。这一特性使得它在不同的分类层次上都能提供独特的分子标记,不仅有助于准确界定物种在种水平上的分类,还能有效地鉴定近缘物种之间的亲缘关系,从而成为真菌在种和亚种水平上分类鉴定的重要工具。
ITS序列能实质的反映出不同种属以及种内各个体间的碱基对差异，利用ITS的序列信息开发遗传标记已被广泛应用于真菌属内不同种间或近似属间的系统发育研究。18S rDNA基因编码真核生物核糖体小亚基rRNA，是一段进化缓慢而相对保守的序列，在结构上分为保守区和可变区，保守区和可变区分别反映了不同个体间的亲缘关系以及...
🌱 18S rDNA测序: 18S rDNA,真核生物的核糖体小亚基rRNA编码DNA,含有可变区和保守区。保守区反映生物亲缘,高变区展现物种差异。选择V4区测序,揭示真核生物群落结构。🍄 ITS扩增子测序: ITS分为ITS1/ITS2,位于真核生物核糖体rDNA的特定区间。通过测序ITS1或ITS2,进一步解析环境微生物中的真菌多样性。
18S rRNA基因序列长短适中,其结构中既有保守区域,又有变异区域,是较好的生物标志物。人们根据18S rRNA基因不同区域序列的可变性将其分为8个可变区(V1-V9,不含V6): 18S可变区示意图 内转录间隔区(Internal transcribed spacer,ITS)是染色体上SSU rRNA与LSU rRNA之间的一段间隔区。在真核生物中有两类ITS:ITS1...
根据对测序区域和物种的选择,扩增子测序目前主要分为16S rDNA测序、18S rDNA测序、ITS测序及目标区域扩增子测序等,其中16S rDNA测序针对环境中细菌和,18S rDNA、ITS测序针对环境中的真菌。 1、16SrDNA测序 细菌核糖体RNA(rRNA)按沉降系数分为3种,分别为5S、16...
如果研究目标是对广泛的真核微生物群进行较高阶元的多样性和丰度评估,18S rRNA基因测序可能更适合。 如果目标是详细研究特定群体(如真菌)在物种或株级别的多样性和鉴定,那么ITS测序可能更有优势。 百泰派克生物科技--生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商 ...