Fixed RNA Profiling数据表现 ①单细胞固定保存不同时长,数据稳定性很好 10x Genomics内测了人类PBMC单细胞样本在固定0天,4℃保存一周,-80℃保存一个月的数据效果,从下图可以看出,三组数据在细胞类型占比及片段mapping率上具有很高的一致性。 ②针对不同样本类型,Fixed RNA Profiling数据具有很高的一致性 10x 内测...
10x Genomics单细胞FFPE解决方案 我们这里介绍的是在刚刚结束的AGBT大会上展示的初步数据。将一块浸润性导管癌的FFPE组织进行切割后,用手工解离和酶消化相结合的方法将其解离成悬液,然后使用10x Genomics今年最新推出的Fixed-RNA Profiling...
Fixed RNA Profiling数据表现 ①单细胞固定保存不同时长,数据稳定性很好 10x Genomics内测了人类PBMC单细胞样本在固定0天,4℃保存一周,-80℃保存一个月的数据效果,从下图可以看出,三组数据在细胞类型占比及片段mapping率上具有很高的一致性。 ②针对不同样本类型,Fixed RNA Profiling数据具有很高的一致性 10x 内测...
使用Cell Ranger 7.0 分析的Fixed RNA 分析数据集。 使用Cell Ranger 7.0 分析的Chromium细胞核分离试剂盒数据集。 分析指南 使用Seurat 的 HTODemux 函数对 10x Genomics CellPlex 数据进行标签分配 使用Seurat 的 HTODemux 函数对 10x Genomics CellPlex 数据进行自定义标签分配的教程。输出的标签结果可以加载回 Ce...
10x Genomics单细胞FFPE解决方案 我们这里介绍的是在刚刚结束的AGBT大会上展示的初步数据。将一块浸润性导管癌的FFPE组织进行切割后,用手工解离和酶消化相结合的方法将其解离成悬液,然后使用10x Genomics今年最新推出的Fixed-RNA Profiling试剂盒的标准实验方案,进行样本固定后进行单细胞转录组测序。通过对数据进行处理,...
RNA-seq测序原理 基于10X Genomics 平台的高通量单细胞 RNA Seq技术是利用液滴法的原理,使用GemCode技术,通过控制微流体的进入,将带有 barcode、UMI(Unique Molecular Index,分子标签)、引物及酶的凝胶珠(Gel Beads)与单细胞混合,从而实现大规模的单细胞分离,以及单细胞文库构建的技术。
These combined findings support the use of the 10x Genomics Fixed RNA Profiling workflow to obtain high quality single cell gene expression data from FFPE tissues. These data also demonstrate that meaningful gene expression data is produced by multiple tissue types and input amounts, but samples ...
为解决这些难题,博奥晶典引进了 Fixed RNA(RNA 固定)技术。该技术使用多聚甲醛(Paraformaldehyde,PFA)固定组织或细胞悬液,可以在不牺牲完整性或数据质量的情况下,安全地存储和运输样本;此外,利用 Fixed RNA 技术还可实现稳定的混样测序,一次性分析数十万个固定的单细胞,从而为样本获取、管理和处理提供了高效而简化的...
force-cellsOptional.Force pipeline to use this number of cells, bypassing cell detection. Specifying library-levelforce-cellsin the[gene-expression]section is only valid for the singleplex Fixed RNA Profiling configuration; note this flag name has a dash (-). Default: detect cells using Cell Ran...
AGBT一直是10x Genomics最期待的大会之一,今年我们格外激动:不仅仅是因为我们能够展示如何将最新的突破带到您的实验室,还因为这些技术和应用正在单细胞及更高分辨率的水平上重塑各种可能性。本文将带您回顾AGBT大会上的主要更新,文末附有3月9日中文版AGBT网络研讨会的注册链接,我们将详细介绍10x Genomics单细胞,空间...