空间转录组 转录因子分析 什么是10X genomics 10X Genomics 是一个综合的单细胞测序技术公司,可以应用于多种单细胞测序上,包括Single cell gene expression, Single cell Immune Profiling, Single cell CNV, Single cell ATAC,简而言之可以理解为从mRNA捕获到下机的一整套流程,是目前最常用的技术。 10X Genomics Wor...
自此,单细胞转录组文库构建完成,接着就该进行illumina测序。 NGS | illumina测序原理简述 参考文章: https://www.10xgenomics.com/cn/support/single-cell-gene-expression/documentation/steps/library-prep/chromium-single-cell-3-reagent-kits-user-guide-v-3-1-chemistry-dual-index https://www.10xgenomics.com...
方法：10x Genomics高通量单细胞转录组测序（由欧易生物提供技术支持）研究背景 本研究首次通过scRNA-seq分析了免疫细胞和基质细胞在宫颈癌进展过程中转录状态的变化，包括正常组织、HSIL、肿瘤和淋巴结转移灶。本研究将有助于更深入地了解宫颈癌进展过程中TME的细胞特征，并有助于开发抑制宫颈癌的起始和进展的新治疗方法...
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在单个细胞水平对mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其原理是将多细胞生物分离的单个细胞中微量的转录组mRNA 通过高效扩增后再进行高通量测序。单细胞转录组测序能够有效解决组织样本无法破解的细胞异质性难题以及常规RNA-seq 被掩盖的细胞群内的转录组异质性...
10x Genomics单细胞转录组测序(single cell RNA-seq, scRNA-seq),是在单个细胞水平对 mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其能够以高通量和单分子分辨率研究单个细胞表达谱,揭示复杂细胞群体的异质性,避免单个细胞的基因表达信号被群体的平均化所掩盖。 10x Genomics系统具有高通量、周期短、适用范围广等优势,一个样品...
单细胞转录组测序是在单个细胞水平进行高通量转录组测序的一项新技术,能够有效解决细胞异质性以及bulk RNA-seq被掩盖的细胞群内转录组异质性难题,有助于发现新的稀有细胞类型,深入了解细胞生长过程中的表达调控机制。 10x Genomics Chromium系统利用微流控、油包水的微反应体系,通过序列标签(cellbarcode和UMI)区别群体中...
北京诺禾致源科技股份有限公司,提供单细胞转录组测序-10x Genomics 方案知识分享和检测服务,专注于生命科学与研究、肿瘤临床治疗建议、以及人类遗传领域,致力于成为全球领先的基因组学解决方案提供者。
单细胞测序覆盖度高,平均为50,000 reads/per cell 缺点 存在一定doublet or empty droplet 的情况,导致部分数据不可用。 构建出3' cDNA文库,一方面存在3' bias。另一方面检测不到转录剪接等转录后加工事件。 以上就是对10X Genomics平台的简单介绍。
BioSciToolWebsite:Github:亲爱的BioSciTools用户:高校开学已有些时间,此次更新带来基于测序输出结果的单细胞常规转录组(SingleCell RNA-Seq)数据分析程序。多个程序主要参考数据格式和数据分析流程,允许用户执行数据QC、细胞过滤、线粒体基因占比统计、Feature过滤、高变Feature鉴定、PCA分析及JackStraw对PCA的选择、细胞UM...
方法：10x Genomics高通量单细胞转录组测序 研究目的 子宫内膜是播种生命的“土壤”。然而，子宫内膜损伤和宫腔粘连会让这片“土壤”变得贫瘠，从而导致不孕症。宫腔粘连（Intrauterine Adhesions，IUA）又称Asheman综合征，是由于各种原因导致的子宫内膜损伤，引起宫腔纤维化粘连，使宫腔部分或全部闭塞。目前，IUA治疗的...