RNA-seq测序原理 基于10X Genomics 平台的高通量单细胞 RNA Seq技术是利用液滴法的原理,使用GemCode技术,通过控制微流体的进入,将带有 barcode、UMI(Unique Molecular Index,分子标签)、引物及酶的凝胶珠(Gel Beads)与单细胞混合,从而实现大规模的单细胞分离,以及单细胞文库构建的技术。 图1 10X Genomics 技术原理示...
随着单细胞测序技术在生命科学研究领域的广泛应用,单细胞多组学技术应运而生,并且已公开发表了多种检测策略。2019年底,单细胞多组学(Single-cell multimodal omics)被 Nature Method 评为年度技术。 10x Genomi…
10X Genomics 是一个综合的单细胞测序技术公司,可以应用于多种单细胞测序上,包括Single cell gene expression, Single cell Immune Profiling, Single cell CNV, Single cell ATAC,简而言之可以理解为从mRNA捕获到下机的一整套流程,是目前最常用的技术。 10X Genomics Workflow 1、了解Gel beads(凝胶微珠) Gel bead...
10x Genomics单细胞免疫组库测序又称10x单细胞V(D)J测序,指通过特异性提取富集T/B细胞TCR/BCR区域RNA,通过比对、拼接、筛选、注释等构建免疫组库,分析得到TCR/BCR多样性序列,从而获得机体的免疫特征。 利用微流控芯片制备单细胞体系;选择5'端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行V(D)J富集;实现成对的...
染色质的这种特性叫做染色质的易接近性(chromatin accessibility),通过研究细胞特定状态下开放的染色质区域可以在DNA水平上了解其转录调控。 10x Gennomics单细胞ATAC-seq(Single Cell Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,单细胞染色质易开放区域测序)基于GemCode微流体平台,利用Tn5...
10x Genomics单细胞转录组测序通过微流控分选单个细胞,然后通过带有barcode和引物的磁珠与细胞结合,被油滴包裹形成油包水结构,实现了对大量细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平转录表达信息,并依据特征基因的表达对不同细胞群进行鉴定和注释,实现样本、细胞群之间的差异分析、细胞演化过程以及细胞与细胞间的相互...
在此基础上,10x Genomics公司推出了GemCode平台,通过条形码信息将Illumina短序列再次连接,获得更有研究价值的长片段信息。近期,10X Genomics还推出了升级版的Chromium系统,在GemCode的基础上整合单细胞测序。每次实验可分析1000至10000个细胞,增加了检测稀有细胞的灵敏度和准确度。
中科普瑞单细胞平台介绍—10X Genomics单细胞转录组测序服务 10X Genomics的Chromium系统利用油包水的微反应体系,通过序列标签区别群体中的不同细胞和转录本,获得单细胞水平的数字化基因表达谱,可实现数千甚至数万个单细胞群体分析,解决常规scRNA-seq方法在通量或扩展性方面存在的不足,为单细胞研究开拓新的思路。
中科普瑞单细胞平台介绍—10X Genomics单细胞转录组测序服务 10X Genomics的Chromium系统利用油包水的微反应体系,通过序列标签区别群体中的不同细胞和转录本,获得单细胞水平的数字化基因表达谱,可实现数千甚至数万个单细胞群体分析,解决常规scRNA-seq方法在通量或扩展性方面存在的不足,为单细胞研究开拓新的思路。
左一、二:细胞通讯图 右一:转录因子调控分析图 到这里,相信您已经对10x Genomics单细胞转录组测序有了基础的了解,云准科技可为您提供一站式单细胞多组学优质的服务,如您想了解更多关于10x单细胞转录组的信息,欢迎留言或来电咨询。 更多资讯请关注“云准科技”公众号 ...