RNA高通量测序（RNA-seq）是转录组测序技术的一种，可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析，反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异，以及基因单点突变导致的SNP等。
相对于传统的表达谱基因芯片技术,高通量RNA测序无须预先针对已知序列设计探针,即可对研究物种的整体转录组进行检测,在分析转录本的结构和表达水平的同时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点,检测融合基因, 发现新的长非编码RNA(lncRNA)以及环状RNA(circRNA),提供更为全面的转录组信息。 转录组学测...
转录组测序是研究细胞表型和 功能的一个重要手段,可以在细胞或组织水平上对整个转录组的时空表达进行分析。利用高通量测序技术进行转录组测序是一种跨界、可靠、有效的获得转录组信息的手段。相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,提供更精确的定量信息...
转录组测序RNA-Seq是基于二代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的RNA并进行mRNA富集,然后反转录为 cDNA后进行的高通量测序,在此基础上进行片段的拼接组装,从而可得到一个个的转录本,进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解。不同阶段或部位的生物样品的RNA-Seq转录组进行...
高通量测序类型 全转录组测序:指某个物种或特定的细胞在某一功能状态下转录产生的所有 RNA 的总和。 全外显子测序:指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。 全转录组测序与全外显子测序联用:全转录组测序可以提供基因的表达情况,帮助我们了解基因的调控机制;而全...
【技术特点】-- Nadia高通量单细胞转录组测序建库仪 Dolomite Bio专注于高通量单细胞研究,通过将单细胞包在微液滴中,继而对单个细胞进行快速的分析。2017年11月,Dolomite Bio公司隆重推出Nadia高通量单细胞转录组测序建库仪,可平行运行1,2,4,8个样品, 每个样品15min内可生成6000个单细胞库,8通道可建库成功48000个...
因此,本文通过DNA条形码设计,开发了一种高通量、低成本的中药混样转录组测序技术TCM-seq,并且基于该技术,聚焦于人参与三七的主要活性物质总皂苷提取物,在10种不同组织来源的细胞系上,从基因、功能通路、基因共表达模块和分子网络等角度对比研究了不同剂量的人参总皂苷(Panax ginseng saponins,PGS)与三七总皂苷(Panax...
厦门大学化学化工学院杨朝勇教授课题组与合作者在高通量单细胞时间转录组测序技术研究方面取得重要进展,相关研究以“Well-TEMP-seq as a microwell-based strategy for massively parallel profiling of the single-cell temporal RNA dynamics”为题发表于Nature Communications(DOI: 10.1038/s41467-023-36902-5)。
化学化工学院杨朝勇教授课题组在高通量单细胞转录组测序新器件新方法研究方面取得重要进展,相关研究以“Highly parallel and efficient single cell mRNA sequencing with paired picoliter chambers”为题发表于Nature Communications(Nat. Commun., 2020, DOI: 10.1038/s41467-020-15765-0)。