相对于传统的表达谱基因芯片技术,高通量RNA测序无须预先针对已知序列设计探针,即可对研究物种的整体转录组进行检测,在分析转录本的结构和表达水平的同时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点,检测融合基因, 发现新的长非编码RNA(lncRNA)以及环状RNA(circRNA),提供更为全面的转录组信息。 转录组学测...
在微生物学领域，高通量测序可对微生物进行精准检测，以帮助控制疫情和病害爆发。RNA高通量测序（RNA-seq）是转录组测序技术的一种，可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析，反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异，以及基因单点突变导致的SNP等。
全转录组测序:指某个物种或特定的细胞在某一功能状态下转录产生的所有 RNA 的总和。 全外显子测序:指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。 全转录组测序与全外显子测序联用:全转录组测序可以提供基因的表达情况,帮助我们了解基因的调控机制;而全外显子测序可以提...
1.基因组重测序(whole genome sequencing, WGS):高通量测序技术可以在较短时间内低成本地测序出一个个体的全部基因组序列。这种技术的快速发展大大降低了测序的成本和时间,从而使人们能够更广泛地研究不同生物个体之间的遗传差异,进而揭示出许多与疾病相关的基因变异。 2.转录组测序(RNA-Seq):高通量测序技术可以帮助...
高通量转录组测序(High-throughput RNA Sequencing,简称RNA-Seq)被广泛应用于研究基因表达,数量和可变亚转录本,SNP等遗传变异及其在不同发育阶段、不同组织或细胞类型、环境应激及疾病发生等方面的表达调控机制。在这篇文章中,我们将重点介绍高通量转录组测序技术在生物领域中的应用,并讨论其现有局限性和未来发展方向。
转录组测序是研究细胞表型和 功能的一个重要手段,可以在细胞或组织水平上对整个转录组的时空表达进行分析。利用高通量测序技术进行转录组测序是一种跨界、可靠、有效的获得转录组信息的手段。相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,提供更精确的定量信息...
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap FusionLumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOFPro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。 不同技术的比...
转录组测序‖带你入门不踩坑之第10篇 |#转录组测序 是指利用新一代#高通量测序技术对组织或者细胞中所有RNA反转录成cDNA进行测序研究,全面快速获得某一特定样品特定时期的几乎所有RNA序列信息的一种分析技术,可以用于研究基因的表达量、功能、结构、可变剪接和新基因预测等。
一种基于高通量测序技术的宏转录组数据分析方法,具体包括如下步骤: (1)对高通量测序下机的双端序列原始数据进行质量筛查,获取可用于下游宏转录组学分析的高质量数据集; (2)对高质量序列进行核糖体rna序列预测和剔除,得到mrna的转录本序列集; (3)对每个样本分别进行宏转录组序列拼接组装,构建宏转录组contigs和scaffo...