相对于传统的表达谱基因芯片技术,高通量RNA测序无须预先针对已知序列设计探针,即可对研究物种的整体转录组进行检测,在分析转录本的结构和表达水平的同时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点,检测融合基因, 发现新的长非编码RNA(lncRNA)以及环状RNA(circRNA),提供更为全面的转录组信息。 转录组学测...
全转录组测序:指某个物种或特定的细胞在某一功能状态下转录产生的所有 RNA 的总和。 全外显子测序:指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。 全转录组测序与全外显子测序联用:全转录组测序可以提供基因的表达情况,帮助我们了解基因的调控机制;而全外显子测序可以提...
RNA高通量测序(RNA-seq)是转录组测序技术的一种,可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析,反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异,以及基因单点突变导致的SNP等。
转录组测序研究的是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出的mRNA,结合二代高通量测序可以全面地获得该物种在某一状态下的所有转录本信息,可用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。 实验建库 Q1 转录组测序建库方式有哪些?该如...
方法:10x Genomics高通量单细胞转录组测序 研究目的 子宫内膜是播种生命的“土壤”。然而,子宫内膜损伤和宫腔粘连会让这片“土壤”变得贫瘠,从而导致不孕症。宫腔粘连(Intrauterine Adhesions,IUA)又称Asheman综合征,是由于各种原因导致的子宫内膜损伤,引起宫腔纤维化粘连,使宫腔部分或全部闭塞。目前,IUA治疗的...
单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing):是在单细胞水平对转录组进行测序的一项新技术,可以研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实。 特点与难点:单细胞转录组测序技术能让我们获取单个细胞的转录组信息,但单个细胞的...
罗氏GS-FLX-Titanium第二代高通量测序仪平均读长超过400bp,在测序读长上遥遥领先于其它第二代高通量测序仪,使其成为转录组学研究的首选测序平台,已被广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。 一、 罗氏454测序技术在环境微生物生态多样性研究中的突出优势体现在: (1) 测序序列长,便于聚类拼接,可以对转录...
方法:10x Genomics高通量单细胞转录组测序 研究结果 1. 圆锥角膜和健康角膜的细胞类型鉴定 为了全面了解患者的圆锥角膜和健康人正常角膜的细胞多样性和分子特征,研究从板层角膜移植术(DALK)后的圆锥角膜患者中获取3个中央角膜组织,从健康对照者中获取4个对照的中央角膜组织。将每个样本的组织分离,分别进行10X ...
相比于传统的芯片杂交方法,转录组高通量测序技术具有显著的优势。首先,它摒弃了对已知序列的预先设计探针的需求,这使得它能够对任何物种的转录活动进行全面且实时的分析,展现出前所未有的灵活性。这种方法无需预先设定,能够直接捕捉到转录组的动态变化,为研究提供了极大的便利。其次,转录组测序提供了更...