近几十年来，研究人员在鉴定、开发和优化靶向蛋白质相互作用（PPI）的小分子方面取得了重大进展。高分辨率蛋白质结构分析工具，如X射线晶体衍射、核磁共振和冷冻电子显微镜，使得PPI复合物能够在原子水平上表征，促进潜在靶点的发现和合理的药物设计。大多数PPI靶向药物需要热点，现在正在使用Q-SiteFinder等先进的计算工具进...
β-catenin与BCL9相互作用的表面与其他β-catenin结合蛋白相互作用的表面几乎没有重叠,而E-钙粘蛋白(区域V)是唯一已知的结合这种PPI的蛋白质接口。 尽管开发β-catenin与BCL9的蛋白与蛋白相互作用抑制剂有挑战,但是目前也有一些破坏它们相互作用的抑制剂被报道。...
其中,蛋白质组学方法导致在不同模型物种和几种人类细胞系中建立蛋白-蛋白相互作用(Protein-Protein Interaction:PPI)网络。 PPI网络是高度互联的,一些蛋白质表现为中枢,并且涉及大量的相互作用。中枢蛋白的典型实例是网络中显示为中心节点的人蛋白质p53,发现在多种类型的癌症中突变。导致抑制蛋白功能的突变可能影响PPI网...
其中,蛋白质组学方法导致在不同模型物种和几种人类细胞系中建立蛋白-蛋白相互作用(Protein-Protein Interaction:PPI)网络。 PPI网络是高度互联的,一些蛋白质表现为中枢,并且涉及大量的相互作用。中枢蛋白的典型实例是网络中显示为中心节点的人蛋白质p53,发现在多种类型的癌症中...
靶向蛋白-蛋白相互作用(PPI)以及通过相互作用而形成的蛋白复合物是细胞完成各项基本功能的重要基础.大多数重要的生命活动,如DNA的复制与转录,蛋白质的合成与转运,细胞信号转导与物质代谢调节等,都是通过密集的PPI网络维持的.基因突变,表观遗传学改变,细胞微环境变化能够干扰PPI模式或者直接诱导蛋白结合,形成新的,肿瘤...
蛋白- 蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI) 是细胞进行生命活动重要基础[1]。作为病理信号传导的中枢,PPI 在肿瘤的发生、发展、侵袭与迁移过程中发挥着关键作用。PPI 界面因面积大、形状复杂等特点难以结合小分子药物,因而长期以来被认为是“不可成药”的靶点。随着蛋白质组学的飞速发展,靶向PPI 的药物成为...
摘要:2023年10月2日,北京大学全军民教授团队联合中山大学卜宪章教授团队在Nature Communications在线发表了题为“Development of cyclopeptide inhibitors of cGAS targeting protein-DNA interaction and phase separation”的研究论文,这项研究通过靶向PPIs(蛋白质-蛋白质相互作用)环肽库的体外筛选,鉴定出一类新型cGAS环肽抑制...
图1 XQ2与cGAS结合并阻断cGAS-DNA相互作用[1] 为了从大环肽库中筛选靶向蛋白质-DNA界面的cGAS抑制剂,作者应用了一种基于RNA的荧光生物传感器来检测2',3'-cGAMP,用于体外筛选cGAS活性抑制剂,并通过细胞实验进一步筛选验证。在体外蛋白水平和细胞水平测定中苗头分子(hits)之间的抑制活性差异可能归因于它们不同的细胞渗...
2023年10月2日,北京大学全军民教授团队联合中山大学卜宪章教授团队在Nature Communications在线发表了题为“Development of cyclopeptide inhibitors of cGAS targeting protein-DNA interaction and phase separation”的研究论文,这项研究通过靶向PPIs(蛋白质-蛋白质相互作用)环肽库的体外筛选,鉴定出一类新型cGAS环肽抑制剂。
我院王任小研究员团队以蛋白-蛋白相互作用体系(protein-protein interaction)为靶标发展小分子调控剂,为创新药物发现提供新的机会。在过去几年中,该团队选择对自噬泡的延伸与自噬体的成熟至关重要的ATG5与ATG16L1形成的蛋白-蛋白相互作用体系为靶标,应用药物分子设计技术,发展可以调控该靶标体系生物功能的小分子活性化合...