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本文涉及两种展现分子表面静电势分布的做法,第一种是196文中已经详细交代的,用Multiwfn的主功能12对静电势做定量分子表面分析导出表面顶点文件vtx.pdb,载入到VMD中显示出来,并根据vtx.pdb的B因子字段数据(对应静电势)来着色。第二种是类似《基于Multiwfn产生的cube文件在VMD和GaussView中绘制填色等值面图的方法》(http:...
图2. 半透明的静电势图 3. 绘制分子轨道 打开.chk结果文件——右击——Edit——MOs 新面板的New MOs选项卡中,点击Load(加载.chk计算结果)——Visualize选项卡中,点击Update 此时展示LUMO如下(修改透明度的方法与上文类似,右击修改): 图3. LUMO 点击右上方框内HOMO轨道(本例中为25号轨道)右侧的灰色正方形 此...
起因是因为要绘制几个插图,而且范围限制在了开源软件(或者免费)。直接通过原子半径或者Van der Waals半径+原子所带电荷信息对静电势图进行武断的推测对于需要的插图是不合适的——例如NaCl分子中Na附近的电子密度小于Cl,所获得的等密度面应当Na小而Cl大。而一些同核双原子分子没有电荷信息,也无法通过这种方法绘制。
MS建模教程10-电子密度与静电势的三维等值面与二维切片 Volume Visualization工具的使用【Materials Studio教学】MS杨站长 MS杨站长 22:04 Didocute 08:58 3-带极值点的静电势图(ESP)-作图过程 贱小贱0220 09:00 高斯View基础操作教学 厘梒儿吖 87052
gview里直接绘制大体系表面静电势其实最坑爹的是调用cubegen计算电子密度格点数据计算太慢，虽然它在调用...
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DMol3绘制分子静电势图图一颜色标尺是我绘制的图,图二是文献中的,请问怎么绘制图二的颜色标尺 发自小木虫Android客户端回复此楼» 猜你喜欢review finalized 两周了没动静,怎么办啊? 已经有8人回复 催化方向 全奖博士-CSC博士-洪堡合作博后招生 已经有7人回复 :参加学术会议发现,没帽子的基本不属于学术圈了 ...
不需要。绘制静电势图不需要计算单点能，静电势图是描述分子或原子系统中各点电势的图形，与系统的总能量有关，并不需要计算单点能，单点能是指系统中某个特定点的能量，而静电势图描述的是整个系统的能量分布情况，因此，绘制静电势图时，只需要计算系统的总能量并在空间中分布即可，而不需要计算每个...