随着测序技术的不断发展,尤其是近些年崛起的长度长测序,产生了大量的长读长序列,如何高效率地将这些reads比对到参考序列上,成了人们关注的重要问题。正文 1. 简介 本文介绍一款专门应用于单分子测序single-molecule sequencing (SMS)产生的序列比对分析工具,具有鲁棒性(robust)强,灵敏度(sensitive)高等优势。软...
最长公共子序列(Longest Common Subsequence,以下简称LCS),该方法的定义为一个序列Subsequence,如果它属于两个或两个以上已知序列的子序列,并且是所有符合条件的子序列中最长的一个,则我们称这个序列为已知序列的最长公共子序列,在文本比对中,可通过该方法在多个比对文本中筛选出所有公共特征块。传统的文本比较方法中除了...
【NCBI-BLAST】-- NCBI—Blast 工具介绍 I 用序列查基因 I 目标序列序列比对 I 比对结果分析 I 比对序列下载---时间较长,谨慎食用 40:35 【干货】如何使用NCBI寻找基因DNA、mRNA及蛋白质序列【瞎说的】 13:15 【NCBI查找基因启动子序列】--极简版(没有半句废话!!!) 09:48 【NCBI 外显子序列查找】...
更多“相同长度的DNA序列,使用哪个工具其比对消耗时间最长()”相关的问题 第1题 使用动态规划算法求两条长度分别为m和n的序列的最长公共子序列,其时间复杂度为( )。 A、O(n^2) B、O(m^n) C、O(nlogm) D、O(n*m) 点击查看答案 第2题 对于求取两个长度为n的字符串的最长公共子序列问题,利用(...
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