结果显示,肾上腺、肝脏和甲状腺中FDX1的表达水平较高,而血液、大脑和胰腺中的表达水平较低。然后,肿瘤细胞系中FDX1表达的结果显示,根据CCLE数据库,它在肠道、胃、造血和淋巴组织中表达最高,在胸膜和上呼吸道中表达最低。 图1 根据癌症基因组图谱(TCGA)和基因型组织表达(GTEx)数据库,FDX1在人类泛癌中的差异表达...
图7. 铜死亡特征风险评分（CSRS）低（AGS）和高（HGC-27）亚型胃癌细胞中铜死亡相关蛋白的表达和药物敏感性差异 (A)WB分析显示CSRS低（AGS）和CSRS高（HGC-27）亚型中FDX1、LIAS、DLAT、DLST、GCSH、DLD、PDHB、PDHA1和β-actin的表达情况。(B-D) CSRS低（AGS）和CSRS高（HGC-27）亚型胃癌细胞对NSC...
FDX1在METTL16-sh细胞中显示出与对照细胞相比最显著的mRNA水平降低(图3e和补充图3D)。此外，在METTL16-Sh或-KO细胞中检测到FDX1的蛋白水平显著降低(图3F，g)。考虑到FDX1是铜离子载体诱导细胞死亡的关键调控因子，我们推测METTL16诱导的细胞死亡是依赖于FDX1的。接下来，研究人员评估了METTL16是否通过影响FDX1的...
01 FDX1在泛癌中的表达 在TIMER数据库中(图1A),FDX1在大多数癌组织中的表达明显低于正常邻近组织,如BRCA、CHOL、COAD、KICH、KIRC、KIRP 、LUAD、LUSC、READ、SKCM和THCA。作者还使用了来自TCGA和GTEx的数据比较TIMER数据库中缺失的FDX1的表达情况(图1B),发现FDX1在ACC、PCPG和WT中的表达显著降低,而在GBM、...
1. FDX1模式的表达及其在泛癌症中的临床特征 首先,为了研究FDX1在肿瘤和正常组织中的差异表达,作者从TCGA数据库获取了FDX1的mRNA表达数据。差异表达分析结果显示,在胶质母细胞瘤(GBM)、脑低级别胶质瘤(LGG)和胃腺癌(STAD)中,FDX1在肿瘤组织中的表达水平高于正常组织(图1A)。而在乳腺浸润性癌(BRCA)、胆管癌(CH...
01FDX1在泛癌中的表达 在TIMER数据库中(图1A),FDX1在大多数癌组织中的表达明显低于正常邻近组织,如BRCA、CHOL、COAD、KICH、KIRC、KIRP 、LUAD、LUSC、READ、SKCM和THCA。作者还使用了来自TCGA和GTEx的数据比较TIMER数据库中缺失的FDX1的表达情况(图1B),发现FDX1在ACC、PCPG和WT中的表达显著降低,而在GBM、...
4.FDX1的表达水平对不同变量的影响 1) FDX1在单细胞中的表达水平与肿瘤的功能状态之间的关系 通过CancerSEA数据库分析了FDX1在COAD单细胞中的表达及其与肿瘤功能状态的关系,发现FDX1在COAD中的表达与 "被遏制"和 "炎症 "呈明显正相关;相反,FDX1的表达与 "侵袭 "呈负相关(图5)。
接下来,研究人员评估了METTL16是否通过影响FDX1的表达来调节铜死亡。鉴于蛋白质脂化是铜死亡的关键因素,研究人员使用硫辛酸特异性抗体作为衡量二氢硫辛酰胺 S-乙酰转移酶(DLAT)脂化的指标,评估了METTL16基因敲除是否影响了蛋白质的脂基化。结果表明,通过免疫印迹法检测,METTL16基因敲除导致DLAT脂基化减少(图3H)。此...
在过表达SLC31A1的细胞中，铁死亡、坏死性凋亡和凋亡抑制剂并不能阻止铜诱导的细胞死亡，而铜螯合剂、FDX1敲除和LIAS敲除各自部分却可缓解铜离子载体产生的细胞杀伤作用。最后，使用老年 ATP7B 缺陷小鼠 (Atpb7b−/−，铜失调综合征 Wilson’s disease 模型) 与杂合子 (Atpb7b+/−) 和野生型对照小鼠对比...
A：铜稳态示意图；B-C：过表达SLC31A1，CuCl2 处理细胞；D：用 Nec-1 等处理过表达 SLC31A1 的细胞，加入 CuCl2，检测细胞活力；E：FDX1 KO 细胞中过表达 SLC31A1，加入 CuCl2 处理后检测细胞的活力；F：检测 Atpb7b-/-小鼠与对照组肝脏的蛋白质含量 总结：这项研究通过利用多种死亡方式的诱导剂与抑制...