铁死亡相关基因 铁死亡(Ferroptosis)是一种铁依赖性的细胞程序性死亡方式,其发生过程需要细胞内铁的聚集、脂质过氧化物和活性氧(ROS)的积累。细胞铁死亡的主要形态特征为线粒体皱缩,线粒体膜密度增加,线粒体嵴减少或消失。生化表现为谷胱甘肽(GSH)耗竭,谷胱甘肽过氧化物酶(GPX4)活性下...
铁死亡相关基因 铁死亡(Ferroptosis)是一种铁依赖性的细胞程序性死亡方式,其发生过程需要细胞内铁的聚集、脂质过氧化物和活性氧(ROS)的积累。细胞铁死亡的主要形态特征为线粒体皱缩,线粒体膜密度增加,线粒体嵴减少或消失。生化表现为谷胱甘肽(GSH)耗竭,谷胱甘肽过氧化物酶(GPX4)活性下降,脂质过氧化物增多和活性氧的聚...
然后对差异表达的lncRNAs和铁死亡相关基因之间进行Pearson相关分析,根据相关系数|R|>0.3和p<0.05得到1748个DEfrlncRNAs。再通过单变量Cox回归检测到157个预后相关的DEfrlncRNAs,和使用LASSO回归分析得到44个另外的lncRNAs。最后,使用多变量Cox回归分析得到18个独立的预后相关的DEfrlncRNAs,并以此构建预后模型。这18个lncRNAs的...
在本研究中,我们从公共数据库中分析了 LUAD 患者中铁死亡相关基因 (ferroptosis-related genes,FRGs) 的差异表达,以确定丰富的途径及其生物学功能,并构建了基于 FR-DEGs 和临床因素的 LUAD 预后评估模型。先前的证据表明,CD8+T细胞通过下调SLC3A2和SLC7A11 来增...
铁死亡的的本质是谷胱甘… 谱领代谢组学Profleader FerrDb — 铁死亡研究分析利器! 铁死亡(Ferroptosis)是一种铁依赖性的调节性细胞死亡方式,与多种人类疾病(例如癌症、心血管疾病和退行性疾病等)紧密相关。铁死亡的过程很复杂,由多种代谢物和生物分子组成,也有一些特… 云生信学生物信息 铁死亡十篇高分文章深入解读...
直肠癌(RC)是最常见的恶性肿瘤之一。铁死亡是一种铁依赖性的细胞死亡形式,在各种癌症中起重要作用。然而,铁死亡相关基因(FRG)与RC预后之间的相关性尚不清楚。 方法 1、从癌症基因组图谱(TCGA)获得直肠腺癌(READ)肿瘤样本和,从GEO获得GSE87211。从FerrDB数据库获得了人类FRG。人类蛋白质图谱(HPA)用于验证基因的免疫...
铁死亡相关基因是从FerrDb 数据库下载的。通过维恩图确定了胶质瘤中三个上调的铁死亡基因(FANCD2、EGFR和SLC40A1)和两个下调的铁死亡基因(GABARAPL1和TF)(图1A、B)。 图1 02 铁死亡基因表达与胶质瘤的预后 作者分析了FANCD2、EGFR、SLC40A1、GABARAPL1、TF在患者预后中的作用。FANCD2高表达的患者在所有WHO级别的...
直肠癌(RC)是最常见的恶性肿瘤之一。铁死亡是一种铁依赖性的细胞死亡形式,在各种癌症中起重要作用。然而,铁死亡相关基因(FRG)与RC预后之间的相关性尚不清楚。 方法 1、从癌症基因组图谱(TCGA)获得直肠腺癌(READ)肿瘤样本和,从GEO获得GSE87211。从FerrDB数据库获得了人类FRG。人类蛋白质图谱(HPA)用于验证基因的免疫...
RRMS相关模块基因与铁死亡相关基因交集 从WGCNA中提取了2952个与RRMS相关的模块基因,将它们与从FerrDb获取的259个FRG进行比较,结果发现了50个交集基因,这些基因被称为交集的RRMS相关模块基因(图4A、B)。 交集基因的相关性和功能富集分析 作者对从RRMS相关模块基因和FerrDb中获得的FRG的交集中的50个基因进行了相关性分析...
发现这三种模型在TCGA数据上的1、2、3年AUC均低于本文的模型,说明具有良好的预测性能。 图8 小编总结 这类铁死亡相关基因的预后模型构建和免疫分析的文章之前也解读过,研究的思路和方法大致相似,但本文的模型通过与之前研究的模型进行比较,具有一定的优越性,这也可以给大家提供参考!