基因重叠群测序与序列组装原理 基因重叠群测序(overlap-layout-consensus sequencing,OLC)是一种基于序列片段的重叠关系来组装基因组的方法。其原理主要包括以下几个步骤: 1. 序列建图:将所有输入的序列片段构建成一个序列图,并找出序列片段之间的重叠关系。重叠关系可以通过比对序列片段之间的相似性来确定,例如使用Smith...
末端测序的读1和读2进行拼接;(5)将拼接后的序列进行序列组装;其中,所述二代双末端测序的读1和读2的序列有5bp以上的重叠区域.本发明方法和系统通过实验建库,根据测序读长选取建库和切胶范围,并结合拼接软件进行拼接,达到了延长序列读长的目的,用延长后的序列根据重叠关系进行重叠群组装,达到提高重叠群组装的指标...
一种二代序列基因组重叠群的组装方法和系统专利信息由爱企查专利频道提供,一种二代序列基因组重叠群的组装方法和系统说明:本发明涉及基因组重叠群的组装方法,特别涉及一种二代序列基因组重叠群的组装方法和系统,所述方法包...专利查询请上爱企查
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基因组测序时Contig的质量判断引入了一个统计学的估算,即( ),大于其的重叠群可被入选,进入下一步的组装。A.Contig N90B.Contig N50C.Cont
第一方面,本发明提供一种二代序列基因组重叠群的组装方法,包括如下步骤: (1)提取样品基因组并超声打断; (2)将步骤(1)超声打断的片段凝胶纯化并切胶,以构建不同插入片段的文库; (3)将步骤(2)得到的文库进行二代双末端测序; (4)将各个文库的二代双末端测序的读1(read1)和读2(read2)进行拼接; ...
摘要: 本发明涉及基因组重叠群的组装方法,特别涉及一种二代序列基因组重叠群的组装方法和系统,所述方法包括如下步骤:(1)提取样品基因组并超声打断;(2)将步骤(1)超声打断的片段凝胶纯化并切胶,以构建不同插入片段的文库;(3)将步骤(2)得到的文库进行二代双末端测序;(4)将各个文库的二代双末端测序的读1和读2...
专利内容由知识产权出版社提供 摘要：本发明涉及基因组重叠群的组装方法，特别涉及一种二代序列基因组重叠群的组装方法和系统，所述方法包括如下步骤：(1)提取样品基因组并超声打断；(2)将步骤(1)超声打断的片段凝胶纯化并切胶，以构建不同插入片段的文库；(3)将步骤(2)得到的文库进行二代双末端测序；(4)将各个...
一种基因组重叠群二代序列组装方法和系统专利信息由爱企查专利频道提供,一种基因组重叠群二代序列组装方法和系统说明:本发明公开了一种基因组重叠群二代序列组装方法和系统,所述方法包括:将样品基因组DNA打断至第一...专利查询请上爱企查
摘要：本发明公开了一种基因组重叠群二代序列组装方法和系统，所述方法包括：将样品基因组DNA打断至第一预定长度范围；对打断的DNA片段切胶选择第二预定长度范围，以构建不同插入片段的文库；对所述第二预定长度范围的DNA片段进行双末端测序，针对特定DNA片段得到具有重叠的第一读长序列和第二读长序列；对各个文库双...