5. 构建遗传连锁图谱:通过分析RIL群体中个体的基因型和相关表型数据,使用计算方法和统计模型,可以推断不同标记位点之间的连锁关系和距离,从而构建遗传连锁图谱。通过RIL作图群体的遗传连锁图谱构建,可以帮助确定基因座的位置、连锁关系和分离度。这在研究复杂性状的遗传基础、基因定位和相关性分析等方面都具有重要应用价值。
《鲈鱼基因内微卫星标记连锁图谱构建》是依托中国海洋大学，由杨官品担任项目负责人的面上项目。 中文摘要 在育苗亲本中进行一对一亲本杂交，用假测交方法获得作图群体；从cDNA文库中分离含微卫星的功能基因序列，并根据这些序列设计微卫星标记引物；构建鲈鱼基因内微卫星标记连锁图谱。由于作图群体和其他研究群体获得方法...
利用GBS方法对BC1群体的22个雄性不育株和22个可育株组成的子代进行连锁分析，建立了基于SNP的菊苣遗传连锁图谱，并确定了与ms1位点相关的标记。该连锁图谱包含727个SNP群集，分布在9个连锁群，总长度为1,413cM。ms1位点与M4.10b和M4.12 两个SSR标记一起被定位到该遗传图谱中的第9连锁群上，其中M4.12与ms1位点...
构建遗传连锁图谱的方法包括基于单倍型数据和基于SNP(SingleNucleotidePolymorphism,单核苷酸多态性)数据两种方法。二、高密度遗传连锁图谱的构建随着新一代测序技术的发展,基于SNP的数据已经成为构建高密度遗传连锁图谱的主要来源。构建高密度遗传连锁图谱的步骤包括SNP筛选、遗传标记开发、基因型数据获取、连锁关系分析和图谱...
根据基因型鉴定结果,我们首先单独构建了两个群体的连锁图谱,然后基于两个群体的连锁图谱构建了一张高密度SNP整合连锁图谱。两个双亲群体的图谱长度分别为4490.75和4571.95 cM,分别包括25,411和30,131个SNP标记。整合连锁图谱总长为5437.92 cM,共包括44,503个SNP标记(图2-A),平均8.13个SNP标记/ cM。相比于单群体...
连锁图谱是指基因或标记在染色体上的相对位置与遗传距离,遗传距离一般以厘摩(centi-Morgan,cM)表示,1%的重组率对应的遗传距离定义为1cM•世界上第一张遗传连锁图谱是利用5个形态特性标记构建的果蝇X染色体,现在的连锁图谱一般都包含成百上千个标记.建立在重组率估计之上的连锁图谱,是开展遗传研究,基因定位,精细定位...
构建基因组遗传连锁图谱的第一步是收集目标物种的基因组数据。对于人类而言,我们可以从公共数据库(如NCBI、Ensembl等)中获取大量的基因组数据。这些数据可以来自于各种研究项目,例如基因组测序计划和基因组关联研究。此外,还可以利用生物样本库中的数据,包括GWAS(基因组关联研究)和突变数据库等。收集的数据要尽可能多样化...
《基于坛紫菜DH群体的高密度遗传连锁图谱构建》是依托中国海洋大学，由孔凡娜担任项目负责人的青年科学基金项目。中文摘要 利用高信息量的DNA分子标记，构建遗传连锁图谱，将为定位克隆控制重要经济性状的基因、开展紫菜的比较基因组学研究和系统进化研究奠定基础；也将为重要经济性状如生长、抗病力等的标记辅助育种及紫菜的...
《苦荞SSR引物开发、遗传连锁图谱构建及品种资源分析》是依托山西大学，由李艳琴担任项目负责人的面上项目。项目摘要 苦荞是起源于中国的粮药兼备资源，不仅营养全面，而且富含生物类黄酮、多肽、糖醇和D-手性肌醇等高活性药用成分，具有降糖、降脂、抗氧化、清除自由基和抑制肿瘤的功能。由于我国复杂的地理环境，苦荞种质...