二、高密度遗传连锁图谱的构建随着新一代测序技术的发展,基于SNP的数据已经成为构建高密度遗传连锁图谱的主要来源。构建高密度遗传连锁图谱的步骤包括SNP筛选、遗传标记开发、基因型数据获取、连锁关系分析和图谱构建等。通过这些步骤,我们可以获得大量的SNP标记,并利用这些标记构建高密度的遗传连锁图谱。三、重要果实品质...
根据基因型鉴定结果,我们首先单独构建了两个群体的连锁图谱,然后基于两个群体的连锁图谱构建了一张高密度SNP整合连锁图谱。两个双亲群体的图谱长度分别为4490.75和4571.95 cM,分别包括25,411和30,131个SNP标记。整合连锁图谱总长为5437.92 cM,共包括44,503个SNP标记(图2-A),平均8.13个SNP标记/ cM。相比于单群体图谱...
《鸭茅高密度遗传连锁图谱的构建及开花基因定位》是张新全为项目负责人,四川农业大学为依托单位的面上项目。项目摘要 鸭茅是世界著名的多年生禾本科牧草,具有高产、优质、耐荫且适应性强等优点,蕴藏丰富的优异基因资源,开发利用潜力极大。但对该物种分子遗传育种基础研究滞后,育种效率低。开花期是牧草重要农艺性状,对...
遗传连锁图谱的构建首先要选择合适的遗传作图群体。到目前为止,多数植物物种构建遗传连锁图谱多采用单自交群体的衍生群体,这些群体在染色体上只有两个等位位点,遗传差异较少。对某些遗传多态性较差的物种,如烟草、棉花等用这些群体构建遗传连锁图谱的效果不是十分理想。为获得到较好质量的图谱,研究者往往选择遗传差异较大...
紫菜haitanensis图谱porphyra连锁遗传 坛紫菜(Porphyrahaitanensis)遗传连锁图谱的构建①徐燕②***谢潮添**陈昌生**纪德华**高亚辉③*(*厦门大学生命科学学院厦门361005)(**集美大学水产学院厦门361021)摘要:以野生型坛紫菜(Porphyrahaitanensis)纯系(♀)和红色型坛紫菜纯系(♂)作为杂交亲本,结合四分子分析法及单个体细胞...
连锁图谱构建步骤一:分群;情形1: k=0, 即当前没有任何标记群;情形2: k0, 即已经产生一些标记群, 适用于有锚定标记的分群;分群结果的不确定性;QTL IciMapping中的排序算法;组合数学中的旅行商问题 (traveling salesman problem, TSP);Finding the solutions ;The solution for TSP “sw24978”;标记排序与TSP...
利用这些数据,我们可以找到基因之间的遗传连锁关系,并据此构建遗传连锁图谱。 构建基因组遗传连锁图谱的第一步是收集目标物种的基因组数据。对于人类而言,我们可以从公共数据库(如NCBI、Ensembl等)中获取大量的基因组数据。这些数据可以来自于各种研究项目,例如基因组测序计划和基因组关联研究。此外,还可以利用生物样本库...
《鲈鱼基因内微卫星标记连锁图谱构建》是依托中国海洋大学,由杨官品担任项目负责人的面上项目。 中文摘要 在育苗亲本中进行一对一亲本杂交,用假测交方法获得作图群体;从cDNA文库中分离含微卫星的功能基因序列,并根据这些序列设计微卫星标记引物;构建鲈鱼基因内微卫星标记连锁图谱。由于作图群体和其他研究群体获得方法...
连锁图谱是指基因或标记在染色体上的相对位置与遗传距离,遗传距离一般以厘摩(centi-Morgan,cM)表示,1%的重组率对应的遗传距离定义为1cM•世界上第一张遗传连锁图谱是利用5个形态特性标记构建的果蝇X染色体,现在的连锁图谱一般都包含成百上千个标记.建立在重组率估计之上的连锁图谱,是开展遗传研究,基因定位,精细定位...