本次的目的是，使用pymol对蛋白结构进行align，结果可以通过肉眼观测或者RMSD进行量化。用法 align mobile, target [, cutoff [, cycles [, gap [, extend [, max_gap [, object [, matrix [, mobile_state [, target_state [, quiet [, max_skip [, transform [, reset ]]]解释：mobile =字符串：...
align首先执行序列比对,然后进行结构叠加,进行多次迭代以便进行微调,在蛋白序列相似性大于30%的时候可以达到良好的效果。 用途 Align常常在结构生物学以及虚拟筛选中使用,当对不同的蛋白结构并对其进行比较时,我们就可以使用align比较蛋白结构,查看两者之间的差异,这个结构上的差异有一个量化的指标就是RMSD。它的概念和计...