一.联合分析的介绍 在研究生物体基因表达和调控中,转录组学和代谢组学的独立研究已经获得了许多研究成果。转录组学可以确定基因表达特征和调控网络,代谢组学可以分析代谢通路、代谢产物含量和变化规律。然而,这两种方法独立的分析只能了解到一部分生物机制。转录组和代谢组之间存在着复杂的相互调控和交互作用。因此,将转录...
尽管目前进行全面的空间蛋白研究在经费上可能不现实,但通过联合分析方法,可以更深入地理解疾病相关的分泌蛋白表达区域,为未来的临床应用奠定基础。 总体而言,文章强调了转录组与代谢组联合分析在疾病研究中的潜力,尤其是在空间组学和单细胞水平上的应用,同时也指出了在临床转化过程中需要克服的技术和方法学挑战。 代谢物...
关联分析:将代谢组学和转录组学的数据进行关联分析,找出代谢物与基因之间的潜在联系。 相关性分析:通过相关性分析,找出代谢物和基因之间的关联性,绘制相关性热图和网络图。 实验验证:根据分析结果,进行实验验证,包括基因功能验证和重构代谢途径的实验。在联合分析的过程中,还需要注意以下几点: 数据处理:确保数据的准确...
花生种合成相关通路的转录组代谢组学联合分析.docx,花生种合成相关通路的转录组代谢组学联合分析 一、简述 在现代生命科学研究中,转录组学和代谢组学是两个重要的研究领域。转录组学主要研究基因的转录和表达调控,而代谢组学则关注生物体内代谢产物的种类、数量、结构和功
转录组学(Transcriptomics) 是一门在整体水平上研究细胞中基因转录情况及转录调控规律的学科 其研究对象是植物细胞在特定功能状态下转录出的所有RNA 的总和,包括...
生物过程具有复杂性和整体性,单一组学的数据难以系统全面地解析疾病发生发展的复杂机制。转录和代谢联合分析可以同时实现从“因”和“果”两个方向来探究生物学问题,相互间进行验证,从海量的数据中筛选出关键基因、代谢物及代谢通路开展后续深入研究与应用,从而提高文章的水平。
该研究首次将代谢组学和转录组学相结合来研究多黏菌素-利福平联合应用增强对铜绿假单胞菌的杀菌作用。该组合对细菌代谢和调节网络产生显著扰动,尤其是在跨膜运输、脂类和碳水化合物代谢、群体感应和毒力方面的变化。强调了多黏菌素联合治疗...
2022年1月,欧易/鹿明生物合作客户浙江大学夏宜平教授课题组在Hortic Res.期刊发表的题为“Photoprotection contributes to freezing tolerance as revealed by RNA-seq profiling of Rhododendron leaves during cold acclimation and deacclimation over time”的研究成果,通过转录组学技术、靶向代谢组学技术研究方法,发现了...
植物遗传资源学报 Journal of Plant Genetic Resources ISSN 1672-1810,CN 11-4996/S 《植物遗传资源学报》网络首发论文 题目: 花生子仁糖代谢转录组-代谢组学联合分析 作者: 马钰聪,赵雨露,李佳伟,刘彬,王春妹,张敏,张利苹,蒋晓霞,穆国俊 DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20211121001 收稿日期: 2021-11-21 网络...
转录组数据分析表明,在北美鹅掌楸花瓣中,基因表达的局部转录调控可能会导致类胡萝卜素的生物合成和积累,使花朵发育过程中花瓣带着色。靶向代谢组学进一步证实类胡萝卜素在北美鹅掌楸花瓣带着色中的作用:特定位点γ-胡萝卜素的局部积累可能是导致北美鹅掌楸花开花过程中花瓣带着色的关键过程。胡萝卜素关键酶的动力学分析...