因此,将转录组学和代谢组学的数据进行联合分析,可以更全面、更深入地了解基因表达和代谢网络之间的关系。 联合分析相比于单独转录组学和代谢组学的研究,通常需要多个步骤:1)数据预处理;2)数据整合;3)数据标准化;4)差异分析;5)生物功能注释。在这一过程中,需要用到统计学方法、机器学习算法等多种方法。联合分析还...
尽管目前进行全面的空间蛋白研究在经费上可能不现实,但通过联合分析方法,可以更深入地理解疾病相关的分泌蛋白表达区域,为未来的临床应用奠定基础。 总体而言,文章强调了转录组与代谢组联合分析在疾病研究中的潜力,尤其是在空间组学和单细胞水平上的应用,同时也指出了在临床转化过程中需要克服的技术和方法学挑战。 代谢物...
关联分析:将代谢组学和转录组学的数据进行关联分析,找出代谢物与基因之间的潜在联系。 相关性分析:通过相关性分析,找出代谢物和基因之间的关联性,绘制相关性热图和网络图。 实验验证:根据分析结果,进行实验验证,包括基因功能验证和重构代谢途径的实验。在联合分析的过程中,还需要注意以下几点: 数据处理:确保数据的准确...
花生种合成相关通路的转录组代谢组学联合分析.docx,花生种合成相关通路的转录组代谢组学联合分析 一、简述 在现代生命科学研究中,转录组学和代谢组学是两个重要的研究领域。转录组学主要研究基因的转录和表达调控,而代谢组学则关注生物体内代谢产物的种类、数量、结构和功
该结果可以进一步提高前面选择的代谢物,基因和通路的可信度。 图5 总结 本研究在转录和代谢水平上解释了宫颈癌的异常代谢,探讨了关键基因在癌症中的作用,并证明代谢组学和转录组学的联合分析是研究癌症发生机制和发现更可靠生物标志物的一种有效方法。 原创: 任胜景 迈维医学...
不同组学分别由不同层面反映果树基因转录到代谢的情况,实现数据互补,更完整地理解果树的各种生理现象背后的调控过程。其中,代谢组学和转录组学关联分析,可实现时序表达的差异基因与差异代谢物的共表达分析,探究基因和代谢物间的因果关系,同时结合功能注释和代谢通路富集等生物功能分析,锁定重点代谢通路、关键基因和关键代...
该研究首次将代谢组学和转录组学相结合来研究多黏菌素-利福平联合应用增强对铜绿假单胞菌的杀菌作用。该组合对细菌代谢和调节网络产生显著扰动,尤其是在跨膜运输、脂类和碳水化合物代谢、群体感应和毒力方面的变化。强调了多黏菌素联合治疗...
通过靶向代谢组学分析发现,在蓝绿色模块中,“淀粉和蔗糖代谢”与碳水化合物代谢有关,“α-亚麻酸代谢”和“亚油酸代谢”是JA生物合成的上游,“类胡萝卜素生物合成”是脱落酸(ABA)生物合成的上游,“苯丙素生物合成”是木质素生物合成的上游。因此,对6个时间点的碳水化合物(葡萄糖、果糖和蔗糖)、ABA、JA和木质素...
研究者通过多组学联合分析,结合非靶向和靶向代谢组学以及转录组学,对花瓣带中被特异性激活的类胡萝卜素生物合成的级联途径进行了鉴定。比较分析北美鹅掌楸和鹅掌楸杂交种的类胡萝卜素代谢产物表明,γ-胡萝卜素,一种植物中罕见的胡萝卜素,是最有可能导致花瓣带着色的橙色色素。对发育中的花瓣的表型和转录组分析表明,...
植物遗传资源学报 Journal of Plant Genetic Resources ISSN 1672-1810,CN 11-4996/S 《植物遗传资源学报》网络首发论文 题目: 花生子仁糖代谢转录组-代谢组学联合分析 作者: 马钰聪,赵雨露,李佳伟,刘彬,王春妹,张敏,张利苹,蒋晓霞,穆国俊 DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20211121001 收稿日期: 2021-11-21 网络...