(7)蛋白质组学和转录组学结果之间的相关性 比对二次刺激后MRL/lpr小鼠BMDM中显著上调的基因和蛋白质(所有三个比较中上调的DEG和DEP),发现5个分子(Calhm6,Isg15,Gbp2,Iigp1,Ifi47)在转录组和蛋白质组中一致上调,而1个分子(Samhd1)在蛋白质组中下调,在转录组中上调。 表1 显示转录组和蛋白质组相关性的...
基于GO富集分析将DEGs进一步分类为113个子集,分析它们在种子成熟过程中的功能作用及相关分子机制,KEGG富集分析对这些DEGs在油茶种子主要代谢过程涉及的分子机制提供参考信息(图3A)。 (3)代谢相关基因相互作用网络分析 黄酮、黄酮醇以及异黄酮类生物合成途径中分别检测到37、9和4个DEGs,构建了蛋白质相互作用(PPI)网络图,...
基于微流控纳升级超微量样品操作技术、深度单细胞蛋白质组分析技术和单细胞转录组测序技术,发展了单细胞同时转录组和蛋白质组(Single-cell simultaneous transcriptome and proteome, scSTAP)分析技术,首次实现针对同一单细胞个体转录组和蛋白质...
然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研究组、研究员张维绮研究组和中科院动物研究所研究员刘光慧研究组、研究员曲静研究组,合作建立Aging Atlas数据库。该数据库从常规转录组、单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组及药物基因...
图8 差异蛋白的注释和富集分析 (7)蛋白质组学和转录组学结果之间的相关性 比对二次刺激后MRL/lpr小鼠BMDM中显著上调的基因和蛋白质(所有三个比较中上调的DEG和DEP),发现5个分子(Calhm6,Isg15,Gbp2,Iigp1,Ifi47)在转录组和蛋白质组中一致上调,而1个分子(Samhd1)在蛋白质组中下调,在转录组中上调。
教授团队与浙江大学良渚实验室王永成团队和傅旭东团队合作,基于微流控纳升级超微量样品操作技术、深度单细胞蛋白质组分析技术和单细胞转录组测序技术,发展了单细胞同时转录组和蛋白质组(Single-cell simultaneous transcriptome and proteome, scSTAP)分析技术,首次实现针对同一单细胞个体转录组和蛋白质组深度联合定量分析。