组织内细胞异质性的基础是细胞转录状态的差异,转录状态的特异性又是由转录因子主导的基因调控网络(GRNs)决定并维持稳定的。因此分析单细胞的GRNs有助于深入挖掘细胞异质性背后的生物学意义,并为疾病的诊断、治疗以及发育分化的研究提供有价值的线索。本文重点介绍单细胞测序中转录因子SCENIC高级分析。 SCENIC分析概念 ...
高丛越橘转录组高通量测序及BHLH转录因子分析SONG YangLIU HongdiZHOU QiangZHANG HongjunZHANG ZhidongLI YadongWANG HaiboLIU Fengzhi
将转录组测序得到的差异表达基因与植物转录因子数据库进行比对分析,是转录组学研究中的一项重要内容。通过比对,可以了解差异表达基因在植物转录因子数据库中的注释信息,进一步探究这些基因的功能和调控机制。这种比对分析有助于深入理解植物基因表达调控的网络,为后续的基因功能研究和分子育种提供有力支持。
植物转录因子做瞬时表达（超表达，干扰，对照），然后转录组测序。可以分析出转录因子调控的下游基因吗？...
测序.使用Loupe Cell Browser进行细胞亚群分群,并获得各个细胞亚群差异染色质开放情况.通过Metascape在线分析工具进行通路和生物过程分析.另外使用Loupe Cell Browser的转录因子可及性区域分析功能寻找各细胞亚群的差异转录因子.最后对差异转录因子ZBTB7B进行实验验证,即脓毒症小鼠和正常健康小鼠肺组织CD3+T淋巴细胞中转录因子...
多花黄精全长转录组WRKY转录因子家族生物信息学分析WRKY转录因子家族在植物生长发育,次生代谢产物合成,生物和非生物胁迫响应等过程发挥着重要的作用.该研究采用PacBio SMRT高通量测序技术对多花黄精进行全长转录组测序,利用生物信息学手段从多花黄精全长转录组中鉴定WRKY家族成员,分析其理化性质,亚细胞定位,系统进化信息及...
bHLH transcription factors are a large family of transcription factors in plants, which play important roles in plant growth and development, secondary metabolism regulation, and hormone response. Red raspberry fruit is rich in raspberry ketone. To investigate the role of bHLH transc...
请问各位做过ChIP-seq的前辈，有比较好的测序公司推荐吗，样品已制备好
产NDM酶大肠杆菌囊泡介导的碳青霉烯类耐药研究 囊泡(Outer membrane vesicles,OMVs)是大多数细菌释放的大小在20到500nm之间的纳米颗粒,具有毒力因子运输,DNA转移,抗生素截获和细菌通讯等多种功能.现有报道显示OMVs... 邓荣萍 - 《郑州大学》 被引量: 0发表: 2022年...