SCENIC是一种专为单细胞数据开发的GRNs算法,是一个基于共表达和motif分析,计算单细胞转录组数据基因调控网络重建以及细胞状态鉴定的方法。它的创新之处在于引入了转录因子motif序列验证统计学方法推断的基因共表达网络,从而识别高可靠性的由转录因子主导的GRNs。SCENIC分析流程 图片 1 GENIE3/GRNBoost:基于共表达情况鉴...
并制备单细胞悬液,通过流式细胞分选获得小鼠肺组织CD45+细胞,然后对该型细胞进行单细胞ATAC测序.使用Loupe Cell Browser进行细胞亚群分群,并获得各个细胞亚群差异染色质开放情况.通过Metascape在线分析工具进行通路和生物过程分析.另外使用Loupe Cell Browser的转录因子可及性区域分析功能寻找各细胞亚群的差异转录因子.最后...
产NDM酶大肠杆菌囊泡介导的碳青霉烯类耐药研究 囊泡(Outer membrane vesicles,OMVs)是大多数细菌释放的大小在20到500nm之间的纳米颗粒,具有毒力因子运输,DNA转移,抗生素截获和细菌通讯等多种功能.现有报道显示OMVs... 邓荣萍 - 《郑州大学》 被引量: 0发表: 2022年...