一、启动子 启动子是DNA序列上的一个区域,位于基因的5'端。它涉及到基因在转录时的起始,当RNA聚合酶II(RNAP II)到达启动子时,它会结合一个转录因子,并开始将DNA转录成RNA。因此,启动子是基因表达过程的一个关键部分,它的作用是通过吸引RNAP II和其他与其配合的蛋白质来启动基因转录。 启动子含有一系列特定的...
一、启动子 Promoter 二、转录因子Transcription Factors,TFs 在日常的生物信息学分析中,查找基因启动子可以帮助我们确定基因的启动开关, 弄清楚基因在何时、何地、何种条件下被激活,从而理解基因的调控和表达。在介绍具体的查找方法之前,我们先来梳理一下这个高频词的概念: 一、启动子 Promoter 启动子是基因转录的特定...
转录因子结合至启动子区域，并改变其启动子功能的强弱，便可引起下游报告基因Fluc转录水平发生变化，进而影响其蛋白翻译，最终底物与荧光素酶反应发生变化，荧光强弱发生改变，最终达成互作功能验证。1）验证转录因子与启动子是否有互作（转录因子过表达载体TF、过表达空载TF-空载）表3. 启动子和转录因子结合验证双荧光素...
1)验证转录因子与启动子是否有互作(转录因子过表达载体TF、过表达空载TF-空载) 表3. 启动子和转录因子结合验证双荧光素酶实验分组 2)在四组的基础上加上各个待验证结合位点突变启动子载体,以验证转录因子与启动子的具体结合位点(结合位点1突变启动子promoter-mut1、结合位点2突变启动子promoter-mut2、结合位点3突变...
转录因子的结合位点是转录因子调节基因表达时,与基因模板链结合的区域。启动子是RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列,它含有RNA聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被转录。 图注:转录因子的基本概念...
打开网址:http://jaspardev.genereg.net/,在最上方框里,输入转录因子NFAT,点击旁边的Quick Search:点击添加图片描述(最多60个字) 接下来我们将promoter序列粘贴到右下角的框中,选中左侧转录因子,点击SCAN: 3. 得到28条转录因子NFAT与IL17A的结合位点,Strand -1没有特殊意义,选择Strand 1即可。
启动子是基因上游的DNA区域,通常包含转录起始位点(Transcription Start Site, TSS),是RNA聚合酶二世结合并开始转录的地方。 转录因子启动子互作指的是不同转录因子之间在调控基因表达时的相互作用。这些相互作用可能包括: 1. 协同作用:一些转录因子可能协同工作,共同增强或抑制某个基因的转录。例如,一个转录因子可能...
终止子 terminator 转录过程中能够终止RNA聚合酶转录的DNA序列 终止子可分为两类:一类不依赖于蛋白质辅因子就能实现终止作用。另一类则依赖蛋白辅因子才能实现终止作用 终止密码子 stop codon 终止肽链合成的信使核糖核酸(mRNA)的三联体碱基序列,UAA、UAG和UGA,它们不编码氨基酸 ...
所谓启动子,是指位于基因上游的特定序列。它们可以被转录因子所特异性地结合,进而招募RNA聚合酶,使其开始转录这个基因。不同的启动子对应不同的基因,因此也就对应着不同的生命过程和功能。 而所谓转录因子,就是可以与启动子结合的蛋白质。它们可以控制基因在何时、何处以及何种程度上被表达。在这些方面,转录因子是调...
启动子截断是分析调控区的重要方式,省时省力,通过预测启动子的结合位点,将不同的结合位点置于不同的截断体之内,即可分析出对应转录因子的调控区域。 需要注意的是,截断体只能从转录起始位点远端截,而不能反过来,为什么呢? 实际上,我们说取启动子2k区...