该研究首次在水稻基因组中系统鉴定了类沉默子和类超级沉默子调控元件(Ouyang et al., 2023 )。我们以这篇文章为例，来看看寻找沉默子和鉴定沉默子功能方法。通过利用ChIP-seq技术检测H3K27me3位点，研究者首次在水稻基因组中系统寻找到了类沉默子（typical silencer-like regions，TSRs）和类超级沉默子（Super sile...
在生物学中，基因表达是一个复杂而精细的过程，涉及多个调控元件的协同作用。这些元件包括启动子、终止子、内含子、外显子、增强子和沉默子，它们共同参与了基因表达的精细调控，确保细胞在不同状态下能够正确地表达所需的蛋白质。那么这些元件你都区分清楚了吗？一、启动子（Promoter）①定义：启动子是一段位于基因上...
通过利用ChIP-seq技术检测H3K27me3位点,研究者首次在水稻基因组中系统寻找到了类沉默子(typical silencer-like regions,TSRs)和类超级沉默子(Super silencer-like regions,SSRs)调控元件。研究者发现H3K27me3关联基因的表达水平显著地低于非H3K27me3关联的基因,并且SSR关联的基因明显低于TSR关联的基因的表达水平(图8...
通过利用ChIP-seq技术检测H3K27me3位点,研究者首次在水稻基因组中系统寻找到了类沉默子(typical silencer-like regions,TSRs)和类超级沉默子(Super silencer-like regions,SSRs)调控元件。研究者发现H3K27me3关联基因的表达水平显著地低于非H3K27me3关联的基因,并且SSR关联的基因明显低于TSR关联的基因的表达水平(图8...
超级增强子通常含有多个调控元件，该研究确定了超级增强子中的一种新的调控元件，并将其命名为——facilitators（促进子），它们本身不具有任何固有的增强子活性，但能够帮助经典增强子更有效地发挥作用。在促进子缺失的情况下，经典增强子无法完全上调其靶基因的表达。总的来说，该研究表明，促进子在增强经典增强子的活性和...
我们的DNA中,表达蛋白质的编码基因只占2%,其余98%的DNA是非编码的,但它们中包含着调控元件,它们能够影响附近的基因表达,从而控制细胞的各个方面。 增强子(Enhancer) 就是DNA中的一种调控元件,它们位于基因之间,在不同的时间和水平上以不同的组合来开关基因。尽管在40多年前就发现了增强子,但其工作原理仍然没有完...
在特定条件下，UTR中的调控元件可以通过影响核糖体的加载、mRNA的降解和转运等途径，精细调控基因表达的时间和空间模式。具体来说，5' UTR通常包含影响翻译效率的顺式作用元件，如上游开放阅读框（Upstream open reading frame，uORF）、内部核糖体进入位点（Internal ribosome entry site，IRES）、G-四链体（RNA G-...
在生物学中,基因表达是一个复杂而精细的过程,涉及多个调控元件的协同作用。 这些元件包括启动子、终止子、内含子、外显子、增强子和沉默子,它们共同决定了基因何时、何地以及如何被转录和翻译0 0 发表评论 发表 作者最近动态 瑾瑜偏爱浅浅咸恰似 2025-01-10 一加Ace 5系列:防水防尘性能大揭秘!...全文 瑾瑜偏爱...
3' UTR中通常包含AU富集元件(AU-rich element,ARE)、miRNA结合位点、细胞内定位信号以及RG4等调控元件,这些元件通过调节mRNA的降解速率、翻译抑制和亚细胞定位,在基因表达的精细调控中发挥重要作用(图1F-I)(Hardy et al., 2024)。接下来,小远将列举相关文献案例介绍5' UTR和3' UTR中重要元件的调控机制。 图1...
基因组中的“暗物质”，即大量存在的非编码DNA序列，其中包含了众多功能性顺式调控元件（CRE），例如启动子、增强子、沉默子以及绝缘子等。对组织特异性基因表达起着至关重要的作用。特别是在眼部发育过程中，这些CRE通过精确调控相关基因的时空表达模式，确保了正常的眼部结构形成及功能维持。然而，对于那些位于非编码区...