以下是表观组测序的几个关键点：1. 主要类型 DNA甲基化测序：通过检测DNA分子中甲基化位点的分布，研究其在基因表达调控中的作用。常见的方法包括全基因组甲基化测序（Whole-Genome Bisulfite Sequencing, WGBS）和目标区域甲基化测序（Methylation Enrichment Sequencing）。组蛋白修饰测序：通过测序组蛋白修饰的状态，如...
以下是表观组测序的几个关键点: 1. 主要类型 DNA甲基化测序:通过检测DNA分子中甲基化位点的分布,研究其在基因表达调控中的作用。常见的方法包括全基因组甲基化测序(Whole-Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)和目标区域甲基化测序(Methylation Enrichment Sequencing)。 组蛋白修饰测序:通过测序组蛋白修饰的状态,如乙酰...
表观基因组涉及多种精确调控的表观遗传特征,例如核酸甲基化、染色质状态、核小体位置、组蛋白修饰 (HM)、转录因子(TF)结合和高级染色质结构。这些特征相互作用,影响邻近基因组的活动而不改变DNA序列,进而控制细胞活动并导致可遗传的表型。单细胞表观基因组测序技术以及相应的计算分析方法已经被开发并广泛应用于许多研...
吴婧怡和所在团队开发的新方法正是基于纳米孔测序。首先，他们利用三代测序成功修正了一些人类基因组中的错误拼接和注释。其次，相比于直接进行三代测序，本次方法做了两个主要改进。一是课题组用酶修饰了基因组上蛋白结合的地方（蛋白结合的区域通常是调控基因表达的区域），且这种修饰可以被三代测序检测到。二是他们...
其基本原理是利用m6A特异性抗体,对细胞内的带有m6A修饰的RNA片段进行免疫沉淀。结合高通量测序技术对沉淀下来的RNA片段进行深度测序,在整个转录组层面揭示RNA甲基化这种转录后RNA表观修饰的整体水平和定位等信息。 RNA甲基化修饰m6A检测热门技术—MeRIP-seq 6、WGBS(Whole Genome Bisulfite Sequencing,全基因组甲基化测序...
在RIP-Seq中,富集峰代 表了全部活跃转录的区域(相对于对照IgG)。利用富集峰的注释绘制富集峰在不同基因组特征上的比例图。从总体上查看峰偏向的基因组特征。 2、差异富集区鉴定和注释 云序生物使用diffReps软件进行差异富集区(differentially enriched peaks,DEPs)鉴定。默认p-value<0.0001,fold change >=2.0作为差异...
表观组测序+scRNA,新前景! 表观组测序是一种研究基因表达及调控可遗传变化的技术,主要分为表观基因组和表观转录组两部分。目前,ATAC-seq和scRNA-seq的联合应用在研究领域非常广泛。 🔍 ATAC-seq技术主要研究染色质的开放性,检测转录调控序列,这些序列与正在转录的基因有很大重合。因此,ATAC-seq常作为转录组的验...
在RIP-Seq中,富集峰代 表了全部活跃转录的区域(相对于对照IgG)。利用富集峰的注释绘制富集峰在不同基因组特征上的比例图。从总体上查看峰偏向的基因组特征。 2、差异富集区鉴定和注释 云序生物使用diffReps软件进行差异富集区(differentially enriched peaks,DEPs)鉴定。默认p-value<0.0001,fold change >=2.0...
表观基因组测序是基于内容的测序(Content-based Sequencing),主要检测DNA复制和修饰,转录因子结合、DNA-RNA水解等,以及细胞核和细胞质中蛋白质对DNA的修饰。这些修饰可以影响DNA的功能——激活或抑制基因的表达。此外,表观基因组测序还可以检测DNA和RNA的构型,以及DNA和蛋白质交互作用。 有许多表观基因组测序技术,例如...
达普生物凝聚团队力量，依托公司星海单细胞建库平台，自主创新开发了星海单细胞表观组测序建库试剂盒。该产品采用自主设计的测序方法：构建的单细胞 ATAC 文库，可以和单细胞转录组文库、普通二代文库在测序平台进行混样测序，实现超高测序通量的同时，大大降低测序成本，具有高时效性、高自由度等独特优势。兼容混样测序...