导读:分子相互作用网络图揭示了细胞内部分子间的复杂相互作用。通过识别网络中密集连接的节点所形成的社区(community),可以揭示它们之间以前未知的功能联系。这些社区可能代表了具有共同功能的功能模块,对于理解细胞生物学过程、疾病机制以及药物靶点的识别具有重要的科学和临床价值。 《Clinical and Translational Medicine》文...
5,提交出图 检查通过,并且参数选好后,点击“提交”按钮,约3s后,会在页面上显示带community的彩色PPI相互作用网络图。我们提供了pdf、svg两种矢量图,png、tiff两种标量图供大家下载使用。可以使用acrobat illustrator等软件编辑矢量图,进行组图,调整文字位置,添加说明等操作,以满足个性化需求。 提供了多种布局,和不带co...
开发用于在分子和纳米尺度上分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的新方法可以深入了解细胞内信号通路,并将提高对蛋白质功能以及其他生物和非生物来源的纳米级结构的理解。计算工具的最新进展,特别是涉及现代深度学习算法的工具,已被证明可以补充描述和合理化 PPI 的实验方法。
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遗传和生化数据表明，与复杂疾病有关的基因通常会汇聚到蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络中。遗传和转录组数据表明，ASD-相关基因在大脑中的特定神经元和非神经元细胞群中有着丰富的表达，其中兴奋性神经元是最强的信号之一。因此，从iPSC中衍生出的神经元 (iNs)可以为研究 ASD提供一种关键的体外神经元细胞模型。
开发用于在分子和纳米尺度上分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的新方法可以深入了解细胞内信号通路,并将提高对蛋白质功能以及其他生物和非生物来源的纳米级结构的理解。计算工具的最新进展,特别是涉及现代深度学习算法的工具,已被证明可以补充描述和合理化 PPI 的实验方法。
最佳信息需要了解突变蛋白所处的整个蛋白质相互作用(PPI)网络或相互作用组。平均而言,每个蛋白质直接与10-15种其他蛋白质相互作用;因此,任何突变的功能后果在相互作用组之外难以预测。先前的研究表明,大多数疾病突变破坏了特定的PPI,而不是影响突变蛋白涉及的所有相互作用。准确表征这些破坏对理解大多数疾病突变的病因至...
蛋白质互作网络(PPI, Protein-Protein Interaction Networks)是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。系统分析大量蛋白在生物系统中的相互作用关系,对了解生物系统中蛋白质的工作原理,了解疾病等特殊生理...
现有蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)预测方法在未知数据集(指的是经常出现在训练集中未看到相互作用的蛋白质的数据集)上进行测试时会出现显着的性能下降。本文从两方面新型蛋白质之间的相互作用的评估框架和基于图形神经网络的方法来解决预测未知蛋白的相互作用。
开发用于在分子和纳米尺度上分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的新方法可以深入了解细胞内信号通路,并将提高对蛋白质功能以及其他生物和非生物来源的纳米级结构的理解。计算工具的最新进展,特别是涉及现代深度学习算法的工具,已被证明可以补充描述和合理化 PPI 的实验方法。