本文作者使用 iPSC 衍生出的兴奋性 iNs、相互作用蛋白质组学和计算方法，为ASD 相关的基因构建脑细胞类型特定的 PPI 网络。ASD相关基因和蛋白质在诱导神经元中表达 利用已有的24 个 ASD 相关基因为工作流程的起点，作者在 iNs 中生成 ASD PPI 网络（图1A），本文将它们及其编码的蛋白质分别称为索引基因（index ...
蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)是许多生物过程的基础。对人类蛋白质组的分析表明,大多数蛋白质并非单独发挥作用,而是作为多单元复合物的一部分。事实上,PPI 是信号转导、代谢调节、环境感知和细胞组织的核心部分。 在这些过程中,PPI 可以改变酶动力学、促进底物通道、形成新的结合位点、使蛋白质失活或改变蛋白质相对于...
近日,kevin C.Eggan和Kasper Lageu团队利用iPSC,在人类兴奋性神经元中的13个ASD相关基因中,构建了它们的蛋白质-蛋白质相互作用网络。文章在最新一期的Cell Genomics杂志上发表,名为“Protein interaction studies in human induced neurons indicate convergent biology underlying autism spectrum disorders”。 ASD包括社交...
蛋白质互作网络(PPI, Protein-Protein Interaction Networks)是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。系统分析大量蛋白在生物系统中的相互作用关系,对了解生物系统中蛋白质的工作原理,了解疾病等特殊生理...
开发用于在分子和纳米尺度上分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的新方法可以深入了解细胞内信号通路,并将提高对蛋白质功能以及其他生物和非生物来源的纳米级结构的理解。计算工具的最新进展,特别是涉及现代深度学习算法的工具,已被证明可以补充描述和合理化 PPI 的实验方法。
蛋白质-蛋白质相互作用是指两个或两个以上的蛋白质分子通过非共价键形成蛋白质复合体（protein complex）的过程。多类型蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的研究是从系统的角度理解生物过程和揭示疾病机制的基础。现有方法在未知数据集（指的是经常出现在训练集中未看到相互作用的蛋白质的数据集）上进行测试时会出现显着的...
蛋白质相互作用（Protein Protein Interaction, PPI）网络或组（Interactomes）是由单独蛋白质通过与其它蛋白质彼此之间形成的永久或暂时的相互作用所构成。PPI网络或组参与了生物信号传递、基因表达调剂、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命工程的各个环节。系统分析大量蛋白在生物系统中的相互作用关系，对于了解生物系统中...
2019年7月,来自华盛顿大学的David Baker教授组在Science上发表了题为“Protein interaction networks revealed by proteome coevolution”的文章,介绍了利用蛋白质组共进化来揭示蛋白质相互作用网络。 ——背景—— 目前已经有许多研究在蛋白-蛋白界面上观察到了残基-残基共进化,但尚未系统地研究蛋白质家族之间在整个蛋白...
简介：蛋白质−蛋白相互作用（PPIs）在生命的生物过程中起着重要的作用，预测PPIs是一个值得关注的关键...
蛋 白质相互作用网络(PPINs)通过节点代表蛋白质,边代表蛋白质之间的相互作用,直观 地展示了蛋白质之间的复杂关系。蛋白质相互作用网络的构建和分析,为我们理解细胞信 号通路、基因调控网络、疾病发生机制等提供了重要的工具。 蛋白质相互作用数据的来源 1. 高通量实验技术:酵母双杂交(Y2H)、亲和纯化质谱(AP-MS)、...