研究人员在标准 PDBbind-v2016 数据集上训练模型,其实验结果在 RMSE 上优于 SIGN 7.5%,在 MAE 上优于 SIGN 9.4%,这证实了所提出的 CurvAGN 模型在改善蛋白质-配体结合亲和力预测方面是有效的。对于蛋白质-配体结合亲和力预测,预测的...
第一部分称为极坐标自适应图注意模块 (PAGA),它使用自适应图注意机制通过结合距离、角度和曲率信息来对蛋白质-配体复合物的 3D 空间结构进行建模。自适应注意机制解决了蛋白质-配体复合图中的异质性。第二部分是池化模块,其中描述并包括用于利用长程相互作用的成对交互池化 (PiPool) 和用于预测蛋白质-配体结合亲...