我们从蛋白质熵计算的原理出发,对构象空间进行划分,通过公式推导发现, 通过对主要构象空间的熵的计算就能估算出整个蛋白构象熵的结果,我们将这 个最主要的构象空间定义为“熵主导构象”,我们对两个蛋白进行分子模拟分析, 进行熵的计算,结果验证了我们的公式。最后我们继续研究了具体蛋白质熵计 算的应用,结果证明,...
该力场是 通过在 ff99SBildn 力场的基础上对天然无规蛋白质中含量较高的 8 个氨基酸残基增加了 CMAP 能量项,这 8 个残基分别为丙氨酸、精氨 酸、甘氨酸、谷氨酰胺、丝氨酸、谷氨酸、赖氨酸和脯氨酸。通过拟 合并优化这 8 个残基的 CMAP 能量项的参数,使得通过分子动力学模 拟获得的 8 个残基的/...
、、、综述与专论蛋白质分子与固体表面相互作用的分子模拟邵庆1,陆小华1,吕玲红1,江绍毅2(1南京工业大学化学化工学院,江苏南京210009;2华盛顿大学化工系,西雅图98195,美国)摘要:蛋白质分子和固体表面的相互作用在与生物有关的材料以及工程领域有着重要的影响 两者相互作用的复杂性使得单纯依靠实验无法得到完整的信息 利用...
2. 使用Ambertools准备好你要计算的蛋白和化合物的prmtop 和 inpcrd 两个文件。不知道怎么准备的请看...
Key words: TCM pharmaceutical wastewater; membrane treatment; XDLVO theory; membrane screening; membrane fouling 中药制药过程中产生的废水有机污染物含量 高,成分复杂,难于沉淀,色度高,水质水量变化 大[1].中药废水处理方法根据作用原理不同,可分 为物理法,化学法,物化法和生化法 4 种[2].由于 中药废水的...
147.材料一:1687年,牛顿出版了《自然哲学的数学原理》,1765年,一种全新的蒸汽机在瓦特的手中诞生了,1776年,亚当.斯密的《国富论》出版。如果说,牛顿为工业革命创造了一把科学的钥匙,瓦特拿着这把钥匙开启了工业革命的大门,那么,亚当.斯密则是挥动一只看不见的手,为工业革命的推进创造了一个新的经济秩序。 材料...
146.生态农业的生产以资源的永续利用和生态环境保护为重要前提,根据生物与环境相协调适应、物种优化组合、能量物质高效率运转、输人输出平衡等原理,运用系统工程方法,依靠现代科学技术和社会经济信息的输人来组织生产。通过食物链网络化、农业废弃物资源化,充分发挥资源潜力和物种多样性优势,建立良性物质循环体系,促进农业...
B. 在增强控制能力和扩大应用范围上,进一步开发各种智能I/O模块 C. 在系统集成方面进一步提高安全性、可靠性 D. 在控制与管理功能一体化方面,进一步减弱通信联网能力 查看完整题目与答案 国家公园发展类型( )。 A. 以美国为例的民族认同感驱动型 B. 以英国为例的自然游憩驱动型 C. 以澳大利亚为例...
然后在Tools中找到Structure Editing分别对小分子进行加氢（Add H）和加电荷（Add charge）处理,电荷选择...
蛋白质在TiO2表面吸附分子动力学模拟.pdf,摘要 当生物材料被植入机体环境后,体液中的蛋白质首先在材料界面吸附,这些吸附 的蛋白质层进一步诱导后续的细胞行为,如粘附、运动、增殖等。在影响蛋白质和细 胞行为的因素中,材料表面拓扑结构显得尤为重要。首先,分别选取了