蛋白与蛋白相互作用分析(双pQTL分析), 视频播放量 3225、弹幕量 2、点赞数 493、投硬币枚数 29、收藏人数 410、转发人数 16, 视频作者 生信狂人团队, 作者简介 医学生信、孟德尔随机化分析课程培训、答疑指导!,相关视频:美利坚洋妞91,10. GO和KEGG富集分析,蛋白-蛋白
探索蛋白质相互作用,可以通过文献,选择互作蛋白间可能发生互作的结构域,建立截短突变或点突变蛋白,分析蛋白互作的变化;还可以通过预测蛋白相互作用的结构域。 1.ZDOCK蛋白-蛋白对接 1.1蛋白结构下载 https://www.rcsb.org/,优先使用来源于实验的PDB(Protein Data Bank )结构,若没有实验结构可以使用来源于AlphaFold的...
常用于测定两种目标蛋白质是否在体内结合,也可用于确定一种特定蛋白的新的作用蛋白。缺点:可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质相互作用。(3)GST沉降技术原理:将细菌表达的谷胱甘肽S-转移酶 (GST)融合蛋白作为探针,与溶液中的特异性蛋白结合,然后根据谷胱甘肽琼脂糖珠能够沉淀GST融合蛋白的能力来确定与融合蛋白...
说到探索分子机制就离不开蛋白与蛋白相互作用分析，除了使用PPI分析以外，我们还可以使用双pQTL分析探索它可能相关的上下游靶点分子。可能很多人会使用PPI分析来找主角分子的靶点分子，但是双pQTL分析没有听说过，下面分享一下如何使用双pQTL分析探索主角分子的靶点分子。例如我们已经确定好主角分子：PKM2，我们现在需要...
图2 提取蛋白单体结构 图3 提取蛋白单体结构 图4 保存蛋白单体结构文件 二、ZDOCK蛋白相互作用分析 ZDOCK网址:ZDOCK Server: An automatic protein docking server (http://umassmed.edu)。具体的操作步骤我们在之前的文章《蛋白互作组学系列丨(七)蛋白互作结构域的预测分析》中介绍过。
说到探索分子机制就离不开蛋白与蛋白相互作用分析,除了使用PPI分析以外,我们还可以使用双pQTL分析探索它可能相关的上下游靶点分子。可能很多人会使用PPI分析来找主角分子的靶点分子,但是双pQTL分析没有听说过,下面分享一下如何使用双pQTL分析探索主角分子的靶点分子。
通过用于蛋白质-蛋白质相互作用分析的大多数胺反应性交联剂,可以在所需的时间内添加过量的亲核试剂(如 Tris 或甘氨酸),这些试剂会使裂解物蛋白与交联剂发生反应。然后可以通过多种方法纯化交联产物,包括沉淀,色谱分析,透析或超滤。 在凝胶电泳准备...
下拉检测分析 标签转移蛋白相互作用分析 远端Western 印迹分析 选择产品 交联剂选择指南蛋白间相互作用的类型 蛋白质相互作用从根本上说是稳定或瞬时的,并且两种相互作用都可以是强或弱。稳定的相互作用是与那些作为多亚基复合物纯化...
该工作介绍了一个基于人工智能框架UniBind,该框架利用深度学习和蛋白质结构分析来预测SARS-CoV-2的刺突蛋白突变的影响。该工作强调了在病毒宿主相互作用和新的SARS-CoV-2变体出现中理解蛋白质相互作用的重要性。UniBind整合了蛋白质三维结构和结合亲和力数据,预测了刺突蛋白突变如何影响其与人类ACE2受体和中和抗体的结合...