一、蛋白质数据库 1.UniProt (The Universal Protein Resource) 网址: http://www.uniprot.org/ http://www.ebi.ac.uk/uniprot/简介:由EBI(欧洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息资源)和SIB(… BOSTER 推荐几个常用蛋白质的序列分析网站 苏州阿尔法...发表于实验室仪器... 某个基因蛋白质Domain Analysis结构域...
这是一个做蛋白质与蛋白质对接的网站,搜ZDOCK就可以搜到。主要步骤如图,注意事项如下: 1、邮箱需要是教育邮箱才会被允许使用,否则就需要向ZDOCK的研发者提出申请 2、我一般选择skip residue,不选之后就会让我们选择对接中不允许哪些氨基酸出现在对接位点中,或者必须出现在位点中,除非已有信息,已有人研究,或者有特殊的...
蛋白对接蛋白在线网站:GRAMM 特大柚子皮 编辑于 2023年07月01日 00:30 GRAMM网址:https://gramm.compbio.ku.edu/ 分享至 投诉或建议 评论2 赞与转发 0 6 0 2
关注刚性对接:pydock zdock gramm-x cluspro 精细对接:HADdock rosettadock3 从序列得到复合物(二聚体):coth(类似的还有rosettafold与Af2complex) 蛋白质与蛋白质对接服务器推荐 - 知乎 (zhihu.com) 发布于 2023-09-08 16:25・IP 属地广东 推荐阅读 蛋白质与蛋白质对接服务器推荐 雾里疯子 蛋白功能预测 hedgeh...
刚性对接方法包括:pydock、zdock、gramm-x、cluspro。精细对接方法有:HADock、rosettadock3。从序列得到复合物(如二聚体)的方法有:coth。类似的方法还有rosettafold与Af2complex。更多蛋白质与蛋白质对接服务器信息,请参考知乎(zhihu.com)。
除了可以用ZDOCK来做蛋白质-蛋白质分子对接,还有什么在线网站或者是软件可以做蛋白质和DNA、蛋白质和蛋白...
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2. DoGSiteScorer网址:链接是我常用的预测蛋白小分子活性中心的网站,将蛋白结构提交到这个网站后,点击Go,选择右边的DoGSiteScorer,再点击calculate,就可以得到7个软件预测的蛋白酶的结合口袋,下方红色download按钮可以下载预测口袋的信息打包文件,包括每个口袋区包含的氨基酸,pocket文件夹下的文件可以用chimera软件作图。3....
确实打不开了,之前对这种对接的服务器挨个进行过测试,发现就swissdock最好使,其他的要么老是报错,...
没有小分子对接蛋白的网站,在线对接,知道的留下网址,谢谢!!! 返回小木虫查看更多分享至: 更多 今日热帖关于MS中Ac模... autodock... Dmol3中TS... 求助:mater... voro++软件... MS中怎么统计键... 仿真一开始原子间... COMPASS力...精华评论 32 1 2 3 4 ››猜...