CADD计算机辅助药物设计设计流程,让学员能够掌握包括PDB数据库、靶点蛋白、蛋白质-配体、蛋白-配体小分子、蛋白-配体结构、notepad的介绍和使用、分子对接、蛋白-配体对接、虚拟筛选、蛋白-蛋白对接、蛋白-多糖分子对接、蛋白-水合对接、Linux安装、gromacs分子动力学全程实操、溶剂化分子动力学模拟 AIDD人工智能药物发现与设...
1.预测蛋白-蛋白相互作用(ZDOCK) 1.1 受体和配体蛋白前期优化准备 1.2 载入受体和配体分子 1.3蛋白蛋白相互作用对接位点设定 1.4蛋白蛋白对接结果分析与解读2. 实例讲解与练习:ZDOCK模拟2019-nCoV的spike蛋白6VXX和ACE2蛋白晶体结构的相互作用构效关系分析1. 3D-QSAR模型构建(Sybyl软件) 1.1 小分子构建 1.2 创建小分...
多组学分析、蛋白质结构预测、分子对接、以及分子动力学模拟是生物信息学中非常重要的几个领域,不同生物信息学任务的关键算法: 推荐硬件配置: 对于生物信息学中的计算任务,特别是多组学分析、蛋白质结构预测、分子对接和分子动力学模拟,强大的 CPU、高性能 GPU、充足的 RAM 和高速存储的强大硬件配置对于获得高效、准确...
分子对接结果表明,10个kokumi肽中,与CaSR蛋白结合最强的3个肽分别为GSH、EL和EK。根据它们的相互作用分析,Arg66、Ser147和Ala168可能是CaSR的活性位点,通过氢键与CaSR相互作用。Kokumi肽可能类似于色氨酸不能单独激活CaSR,但可以在Ca2+存在下促进受体激活。分子对接和分子动力学模拟均表明氢键、静电相互作用和疏水...
“BDE-47和BDE-99与人血清白蛋白的分子对接和分子动力学模拟研究”文献出自《第七届全国环境化学学术大会》。主题关键词涉及有毒理学、人血清白蛋白、多溴二苯醚、分子对接、动力学等。钛学术提供该文献下载服务。
分子对接,分子动力学模拟,小分子蛋白。分子对接,分子动力学,模拟软件在线教学。可做内容包含但不限于: 1、计算帮做:各种体系的分子对接,高清对接结果图、分子动力学模拟及MD结果分析图、结合自由能计算,包括氨基酸残基能量分解、ADMET预测 - 不知道起什么随便起个
药物分子对接是指把一种小分子药物分子与一个大分子生物靶标肽、蛋白或核酸进行结合预测和评估的过程。其目的是通过模拟探索药物分子与生物大分子之间的结构和相互作用,为药物的研发提供理论依据和方向参考。 其中,蛋白质分子动力学模拟是与药物对接研究密切相关的方法之一。蛋白质分子动力学模拟主要是指模拟蛋白质分子...
分子对接动力学人血清白蛋白(HSA)是人体内血液中含量最丰富的载体蛋白质.因此研究血清蛋白与PBDEs的相互作用,对探索PBDEs在人体内的运输,吸收,分布和代谢有非常重要的环境意义.本文利用分子对接和分子动力学(MD)模拟研究HSA与BDE-47和BDE-99的相互作用.由分子对接结果可以看到BDE-47和BDE-99在HSA的位点Ⅱ进行结合...
随后,对复合物的ζ电位和形态的变化进行了进一步的研究。此外,通过分子对接和分子动力学模拟,在分子水平上研究了HCQ与CAS和WP(α-酪蛋白、β-酪蛋白、α-乳清蛋白和β-乳清蛋白)的结合方式。 图1.氯喹、羟氯喹、羟氯喹硫酸盐和羟氯...
分子对接完全没法体现蛋白整体的运动；此外，分子对接未考虑时间因素，只看是否结合，有可能结合上去马上就...