该文献通过蛋白质组学((液相色谱-串联质谱法,LC-MS/MS)进行了探索性分析,样品对应于从健康个体的外周血中分离的幼稚和记忆T细胞,并用多种细胞因子刺激5天,每个条件平均3个生物学重复。 这次复现Fig1cPCA图和Fig2aPCA图的另一部分,这次作者是通过蛋白组学数据进行PCA的展现: 以上是Fig1c原图,图注为“PCA plots ...
前者具有放大效应,抗体会对目标蛋白有一个富集效应,所以只要选对抗体,感兴趣的蛋白基本都会被检测到;而质谱结果中,如果目标蛋白丰度较低,在组学中未检测到也是正常的,质谱检测的后期验证建议用PRM。
该文献通过蛋白质组学((液相色谱-串联质谱法,LC-MS/MS)进行了探索性分析,样品对应于从健康个体的外周血中分离的幼稚和记忆T细胞,并用多种细胞因子刺激5天,每个条件平均3个生物学重复。 这次复现Fig1cPCA图和Fig2aPCA图的另一部分,这次作者是通过蛋白组学数据进行PCA的展现: 以上是Fig1c原图,图注为“PCA plots ...
该文献通过蛋白质组学((液相色谱-串联质谱法,LC-MS/MS)进行了探索性分析,样品对应于从健康个体的外周血中分离的幼稚和记忆T细胞,并用多种细胞因子刺激5天,每个条件平均3个生物学重复。 这次复现Fig1cPCA图和Fig2aPCA图的另一部分,这次作者是通过蛋白组学数据进行PCA的展现: 以上是Fig1c原图,图注为“PCA plots ...
Sanger研究团队于nature communication在线发表了题为Single-cell transcriptomics identifies an effectorness gradient shaping the response of CD4+ T cells to cytokines的研究内容,作者使用蛋白质组学、bulk RNA-seq和单细胞转录组测序对人体40,000个以上的naïve and memory CD4+ T cells进行分析,发现细胞类型之间...
复现PCA原图之蛋白组学数据 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述))、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验...