除了可以用ZDOCK来做蛋白质-蛋白质分子对接,还有什么在线网站或者是软件可以做蛋白质和DNA、蛋白质和蛋白...
3楼:Originally posted bylongdlutat 2018-09-24 04:32:31 很多软件都可以实现,autodock,DS,GOLD...
季铵盐类药物小分子采用DS软件和蛋白进行分子对接,其中季铵盐中的氮原子上连接了三个甲基、一个R基团、...
用途使用ucsfdock6.9程序进行分子对接计算,研究蛋白/核酸/多肽与有机小分子的结合模式与相互作用。预备知识分子对接的算法流程1.将配体放置在受体口袋中,搜索/调整配体构象,获得可能的结合构象;2.对每种结合构象进行打分评估,筛得若干最佳打分构象,称为姿势(pose)或
我用autodock vina 进行蛋白和小分子的对接,无奈得出的结果无法进行 show interaction 操作,总是提示unable to assign HYB type to atom N,查遍小木虫和 autodock 论坛都无法得到解决,所以打算用Pymol 进行分析,也不清楚用Pymol分析是不是也会出现相关联的错误,管不了那么多了,死马当活马医。求虫友帮忙用Sybyl...
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用途使用ucsfdock6.9程序进行分子对接计算,研究蛋白/核酸/多肽与有机小分子的结合模式与相互作用。预备知识分子对接的算法流程1.将配体放置在受体口袋中,搜索/调整配体构象,获得可能的结合构象;2.对每种结合构象进行打分评估,筛得若干最佳打分构象,称为姿势(pose)或
用途使用ucsfdock6.9程序进行分子对接计算,研究蛋白/核酸/多肽与有机小分子的结合模式与相互作用。预备知识分子对接的算法流程1.将配体放置在受体口袋中,搜索/调整配体构象,获得可能的结合构象;2.对每种结合构象进行打分评估,筛得若干最佳打分构象,称为姿势(pose)或
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