1.catRAPID omics 可用于预测与目的RNA结合的蛋白,或者与目的蛋白结合的RNA,点击该条目进入 以lncRNA为例,输入fasta序列(可从NCBI下载) 根据选项,输入要研究的种属,其余根据自身需要自行选择 输入邮箱,点击下方提交,进行分析。分析完成后(约10min),邮件自动提供结果链接,点击进入即可查询,结果如下: 根据结果,可以看到...
根据结果,可以看到与该lncRNA结合的蛋白,依据Ranking进行排序。我们就可以选择感兴趣的进行后续分析啦 2. catRAPID express 可以预测已知RNA与蛋白的具体结合位点。具体用法同上,输入蛋白及RNA的fasta序列,提交即可。 结果如下: 以热图形式显示RNA与蛋白结合的具体位置。红色区域代表结合力较高 部分甚至还可显示具体结合...
catRAPID ：是⼀种⽤于估计蛋⽩质-RNA之间结合倾向的算法。通过结合⼆级结构，氢键和范德华⼒，该⽹站可以⾮常准确地预测蛋⽩质-RNA的结合。该⽹站主要包含以下6个模块 下⾯主要就⼩编使⽤过的功能给⼤家简单介绍⼀下 1. catRAPID omics 可⽤于预测与⽬的RNA结合的蛋⽩，或者...
RNA沉默用shRNA, RNA干扰使用microRNA,干扰,沉默的区别在哪里? 沉默是和靶RNA结合,形成双链RNA并讲解,干扰是和目标片段共同竞争结合位点 帮我推荐一些文献:关于EJC(外显子连接处蛋白结合位点),要理论预测的。。 哺乳动物细胞中的剪接机制使外显子连接复合物(EJC)处于mRNA剪接连接处。本期Cell发表的两篇文章表明EJ...
catRAPID:是一种用于估计蛋白质-RNA之间结合倾向的算法。通过结合二级结构,氢键和范德华力,该网站可以非常准确地预测蛋白质-RNA的结合。 话不多说,上链接:http://service.tartaglialab.com/page/catrapid_group 该网站主要包含以下6个模块 下面主要就小编使用过的功能给大家简单介绍一下 ...
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