数智创新数智创新变革未来变革未来 蛋白质蛋白质--药物相互作用预测药物相互作用预测 1.蛋白质-药物相互作用基础 2.预测模型构建与优化 3.算法性能评估与比较 4.蛋白质结构功能分析 5.药物靶点识别与验证 6.数据整合与预处理技术 7.预测准确性影响因素 8.应用案例与展望 ContentsPage 目录页 蛋白质-药物相互作用...
鉴定新的药物-蛋白质相互作用对于药物发现至关重要,基于机器学习的方法利用药物描述符和一维(1D)蛋白质序列已经开发了许多鉴定方法。这些方法一般都是通过将配体,蛋白质及其相互作用的信息整合到一个统一的框架中,将是否存在相互作用的预测作为二元分类的任务。 最近的研究证明,由于大多数药物包含少于100个重原子,所以具...
为了评估其方法，首先，研究人员利用 MUSE 整合原子结构信息来改进分子网络尺度（scale）预测。MUSE 在蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）、药物-蛋白质相互作用（DPI）和药物-药物相互作用（DDI）这三个多尺度相互作用预测任务上取得了最先进的表现。图 2：MUSE 在预测蛋白质和药物相互作用方面的性能。（来源：论文）从分...
药物-蛋白质相互作用(DPI)的预测对于药物设计和开发至关重要。尽管实验测定法仍然是确定DPI的最可靠方法,但是由于受限于实验测定法的巨额经济成本和大量的时间劳动成本,所以对于药物-蛋白质相互作用的测定一直是令人头疼的问题。 因此,人们将更多的目光投注在使用AI的方式来解决这个医学问题。得益于此,DPI的计算预测最近...
药物与蛋白质之间的相互作用是影响药物疗效的重要因素之一。在药物治疗中,了解蛋白质结构差异对药物相互作用的影响十分重要。 蛋白质结构与功能密切相关。蛋白质的功能是通过蛋白质的三维结构实现的,其中包括了四级结构,即一级结构(氨基酸序列)、二级结构(α螺旋和β折叠)、三级结构(多个二级结构组合形成空间结构)和四级...
MUSE 不仅在分子相互作用(蛋白质-蛋白质、药物-蛋白质和药物-药物)任务方面优于当前最先进的模型,而且在原子结构尺度的蛋白质界面预测方面也优于当前最先进的模型。更重要的是,多尺度学习框架可扩展到其他尺度的计算药物发现。 该研究以「A variational expectation-maximization framework for balanced multi-scale learn...
一、蛋白质与药物相互作用的重要性 蛋白质与药物的相互作用具有重要的临床意义。通过作用于特定的蛋白质,药物可以调节细胞功能、干扰病理过程并治疗疾病。例如,抗生素可以抑制细菌蛋白质的生物合成,从而杀死细菌;激素可以与靶细胞的受体结合,调节细胞生理过程。 此外,了解蛋白质与药物的相互作用有助于药物的研发与设计。
寡核苷酸（ON）类药物的蛋白质相互作用组的方法目前研究较少。通常采用的是体外检测法，即把寡核苷酸药物固定在珠子上并与细胞裂解液孵育，然后用竞争性寡核苷酸药物洗脱蛋白结合体。这种检测方法已成功用于鉴定目前已知的约 80 种反义寡核苷酸（ASO）结合体中的大部分，并构成了现在有关 ON 药物与蛋白质相互作用以及...
#.药物-蛋白质相互作用定义药物-蛋白质相互作用定义:1.药物-蛋白质相互作用(drug-proteininteraction,DPI)是指药物与蛋白质之间的相互作用。2.DPI可以发生在药物与靶蛋白、载体蛋白、代谢酶和转运蛋白等多种类型的蛋白质之间。3.DPI可以影响药物的吸收、分布、代谢、排泄和药效,从而影响药物的安全性与有效性。药物-...