我们可以从HADb(Human Autophagy Database)autophagy.lu/index.html获取自噬相关的基因。在这篇文章的方法部分,我们可以清楚的看到作者从Human Autophagy Database数据库获取了222个自噬相关的基因。接下来小编就带大家一起来获取自噬相关的基因集合 1. 打开HADb的主页,autophagy.lu/index.html2. 点击Clustering菜单,你...
近年来,随着对自噬作用的更深入理解,科学家们发现自噬是衰老以及衰老相关疾病——包括肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病等的关键参与者,也逐渐揭示单个ATG基因的功能及其在疾病和生理过程中的作用,多个自噬基因被看作延长生物寿命的潜在靶点。 目前任职于巴克老龄化研究所(Buck Institute)的Malene Hansen教授多年来也在...
DedA 超家族蛋白，包括 TMEM41B 和 VMP1，Hop1、Rev7 和 Mad2 (HORMA) 结构域蛋白，包括 ATG13 和 ATG101，ATG9 的跨膜部分，脂质转移蛋白 N 端的 chorein-N 结构域，包括 ATG2，以及泛素样 ATG 结合系统）（见图），这表明募集预先存在的基因对于自噬的进化非常重要。
自噬相关基因包括：ATG系列基因、Beclin 1基因、p62基因等。自噬是一种细胞自我吞噬的过程，涉及多个基因的调控。其中，ATG系列基因是最早被发现与自噬有关的基因。ATG基因家族在自噬过程中扮演着重要的角色，参与自噬泡的形成和自噬体的成熟。Beclin 1基因是自噬过程中的一个重要调控因子。它不仅能够调控自...
研究团队通过在文库中引入GFP-Atg8质粒进行自噬活性筛选，共鉴定出29个调控自噬发生的必需基因，其中19个为首次发现。研究团队首先通过同源重组方法，构建了稳定表达水稻TIR1基因的酵母细胞株，随后将AID标签基因克隆到酵母载体pYM16上。通过PCR片段同源重组的方式，研究人员在906个酵母必需基因的C端整合了AID标签，成功...
首先,自噬与一系列基因相关。其中,最为重要的是ATG基因家族,包括ATG1至ATG18等基因。这些基因编码的蛋白质参与了自噬过程中的不同阶段,如诱导自噬、自噬囊泡的扩张和闭合、以及自噬体的降解等。 其次,自噬的调控涉及多条信号通路。其中,最为典型的是mTOR通路和AMPK通路。mTOR是一种重要的抑制自噬的蛋白激酶,当细胞...
从GeneCards数据库获取了149个自噬相关基因(基因相关分数大于7),去除TCGA肺癌样本(包括490个肺腺癌样本和488肺鳞状细胞癌样本)数据中不存在的XBP1基因,构建出148个自噬相关基因的表达谱,结合总生存OS,通过单因素cox回归分析得到了肺腺癌(LUAD)的25个与生存显著相关的基因和肺鳞状细胞癌(LUSC)的11个与生存显著相关的...
生信自噬基因集 生物学中,自噬是细胞内的一种重要的分解过程,它通过溶酶体对储存蛋白、脂类或其他细胞成分的自身膜囊泡进行降解,使细胞能够重新利用分解产物以维持生命活动。自噬过程涉及到许多基因的调控,其中自噬基因集是指与自噬相关的一组基因的总称。 自噬基因集包括许多基因,如ATG5、ATG7、ATG12、ATG16L等。
自噬是一种细胞循环途径，科学家认为它在癌症对化疗等压力的抵抗中发挥作用。科学家们发现，自噬基因也能阻止肿瘤的形成。霍林斯癌症中心的研究员乔·德莱尼博士说，这一发现在老鼠身上得到了验证，它有助于解决几十年来主要基于塑料培养皿中培养的细胞的争论。德莱尼和他的同事、加州大学圣地亚哥分校妇科肿瘤科的德韦恩...
今天小编继续跟大家分享一个最近比较热门的基因集—线粒体自噬相关基因集 线粒体自噬(mitophagy)是真核细胞通过自噬机制选择性清除功能失调或者多余线粒体的一种高度保守的细胞进程,该过程能很好的调整线粒体数目并维持细胞能量代谢的稳定。 在活性氧应激、营养缺乏、细胞衰老等作用下,细胞内的线粒体会出现去极化损伤...