自噬过程涉及到许多基因的调控,其中自噬基因集是指与自噬相关的一组基因的总称。 自噬基因集包括许多基因,如ATG5、ATG7、ATG12、ATG16L等。这些基因的编码产物参与了自噬相关蛋白的翻译和修饰,并在自噬过程中发挥了重要的调节作用。此外,还有许多其他基因与自噬过程密切相关,如ULK1、Beclin-1、LC3等。 自
网址(http://www.bigzju.com/ATdb/#/Homepage),Human Autophagy Database数据库简称ATdb,整合来自TCGA、GEO数据库肿瘤转录组表达谱及临床表型信息,UniProt、HGNC、HPA和ENSEMBL等基因组及蛋白信息,以及Pubmed文献报道数据,囊括25种肿瘤和64种细胞系的自噬相关137个基因、658个miRNA、266个lncRNA、155个PTM和298个DN...
线粒体自噬相关基因集 线粒体自噬是细胞清理受损或多余线粒体的关键机制，维持细胞内环境稳定。这一过程依赖特定基因调控，相关基因集合涵盖信号通路关键分子、调控因子及执行蛋白。以下是线粒体自噬核心基因及其作用解析。PINK1-Parkin通路 PINK1基因编码线粒体膜电位感应蛋白，线粒体受损时，PINK1在膜上聚集并激活。
随着酵母非必需基因敲除库的商业化,已发现更多非必需基因参与各种类型的自噬。然而,由于致死性,约有20%的芽殖酵母必需基因(约1100个基因)无法通过敲除进行进一步研究,这阻碍了系统研究它们在自噬中的作用。利用温度敏感型酵母菌株,研究人员已鉴定...
CRISPR文库锁定自噬相关基因,找出肝癌耐药“元凶” 引言 自噬(Autophagy)是细胞内的“自我清理”过程,能够降解受损的细胞器和蛋白质,维持细胞健康。近年来,自噬在癌症中的作用备受关注,尤其是在肿瘤耐药性方面。最近,一项发表在Autophagy上题为“Genome-Scale CRISPR screen identifies LAPTM5 driving lenvatinib resistance...
KEGG数据库整理出自噬相关基因和信号通路,帮助研究者快速定位关键基因。通过分析这些基因,能更清晰地理解自噬过程如何调控,这对疾病治疗策略的开发有直接意义。 自噬动物通路是KEGG中最核心的条目,编号hsa04140。这条通路覆盖自噬体形成全过程的关键基因,比如ULK1复合体作为自噬启动开关,BECN1调节膜结构的延伸,ATG5-ATG12...
川崎病中自噬相关基因的鉴定与验证 “ 思路: 通过Genecards数据库、MSigDB数据库和基因表达综合GEO数据库。清洗数据和表型基因交集获得DEGs。并采用基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析和蛋白相互作用(PPI)进行分析。此外,预测了相关的microRNAs(miRNAs)、转录因子(TFs)和药物相互作用网络。探讨了免...
首先,自噬与一系列基因相关。其中,最为重要的是ATG基因家族,包括ATG1至ATG18等基因。这些基因编码的蛋白质参与了自噬过程中的不同阶段,如诱导自噬、自噬囊泡的扩张和闭合、以及自噬体的降解等。 其次,自噬的调控涉及多条信号通路。其中,最为典型的是mTOR通路和AMPK通路。mTOR是一种重要的抑制自噬的蛋白激酶,当细胞...
摘要: 目的 基于自噬相关基因(ATGs)构建肝细胞癌病人预后风险模型.方法 TCGA数据库下载374例肝细胞癌及50例正常肝组织的转录组数据和临床信息,首先筛选出差异表达基因(DEGs),然后从中筛选出差异表达的ATGs(DEATGs),最终利用单因素Cox回归分析、LASSO回归分析以及多因素Cox回归分析构建预后风险模型... 查看全部>> ...
平民化延寿 基于自噬生态的低成本长寿 | 一、重新定义“延寿”:从实验室到生活场的范式转移传统抗衰研究困于“药物-疾病”模型,而自噬生态理论提出:衰老是可编程的代谢节律错误,而生活方式是最高效的基因编辑器。 基因杠杆点:通过饮食/运动/环境触发表观遗传开关(如SIRT1去乙酰化、AMPK磷酸化),可比药物更安全地调...