GSE40290、GSE53819和GSE68799中非癌组织的微环境评分高于NPC组(图3E)。此外,生存分析表明,B细胞、记忆B细胞、CD8+ Tcm、iDC和微环境评分与PFS呈正相关(图3G)。B细胞、记忆B细胞、CD8+ Tcm、iDC和微环境评分高的患者比评分低的患者具有更长的PFS。结合上述结果,使用B细胞、记忆B细胞和微环境评分进行进一步分析。
TCGA肿瘤微环境分析(免疫和基质评分)2.0 肿瘤微环境是指肿瘤的发生、生长及转移与肿瘤细胞所处的内外环境有着密切关系,它不仅包括肿瘤所在组织的结构、功能和代谢,而且亦与肿瘤细胞自身的核和胞质内在环境有关。肿瘤细胞可以通过自分泌和旁分泌,改变和维持自身生存和发展的条件,促进肿瘤的生长和发展。全身和局部组织亦...
评估肿瘤免疫微环境需要考虑多种因素,包括T细胞、B细胞、巨噬细胞、树突状细胞、肿瘤相关巨噬细胞、抗原递呈细胞、细胞因子、化学物质等。根据这些因素的存在情况和数量,可以对肿瘤免疫微环境进行评分。 肿瘤免疫微环境评分的结果可以影响肿瘤治疗的选择和预后的判断。例如,如果评分较高,说明肿瘤免疫反应较强,可能对免疫...
肿瘤免疫微环境及免疫浸润--细胞组成成分分析及免疫细胞浸润水平XCELL使用 7470 5 10:46 App 肿瘤免疫微环境及免疫浸润--ESTIMATE算法(纯生信2-3分SCI) 3053 3 2:44 App 肿瘤要生长,微环境很关键,3分钟解释肿瘤微环境是什么? 1012 1 16:38 App 胃癌的肿瘤免疫微环境识别预后以及肿瘤治疗相关的基因标志 331 ...
1.基于肿瘤微环境(TME)进行肿瘤分型 基于TME中代表不同细胞类型的主要生物标志物,包括19种免疫相关成分(例如免疫细胞、免疫相关途径和免疫反应)、9种非免疫基质细胞和7种上皮细胞相关基因,使用ssGSEA算法,根据每个TCGA-READ患者特征生物标志物的表达,分析这些TME成分的丰度。
全文的目的在于找出中枢神经系统低级神经胶质瘤(LGG)肿瘤微环境(TME)中与预后相关的hub基因。 数据 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中筛选了514个中枢神经系统LGG患者,通过组数据共享工具(GDC)提取临床特征和生存数据以及下载转录组数据。 分析方法 TCGA和ESTIMATE评分 ...
Cancer上发表的探究肺腺癌组织学分型的基因组特征的文章" New evaluation of the tumor immune microenvironment of non-small cell lung cancer and its association with prognosis",作者建立了一个新的模型来评估TIME及其与预后的关系,运用TIME评分捕捉肿瘤增值、抗肿瘤免疫和免疫抑制之间复杂的相互作用,可用于肺癌...
目的 通过生物信息学方法构建人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)阴性头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)相关的预后风险评分模型。方法 根据HPV阴性HNSCC患者免疫、基质评分中位数分组,并筛选影响HPV阴性HNSCC预后的TME相关基因。将TCGA数据库HPV阴性HNSCC...
所述基因集对应的肿瘤微环境多基因评分模型预测效能相对于现有的其他模型显著更佳,该模型不仅是胃癌患者的预后标志物,在泛癌中预测效果也相当显著.本发明的模型通过有效地评估肿瘤微环境,不仅能作为良好的预后生物标志物,还能够预测多种肿瘤的检查点抑制剂免疫治疗反应,对于更好的筛选出免疫治疗的获益人群,具有重要的...
专利名称 一种用于预测胃癌免疫治疗的肿瘤微环境评分系统的构建方法以及分子探针 申请号 2021106077859 申请日期 2021-06-01 公布/公告号 CN113528509A 公布/公告日期 2021-10-22 发明人 廖旺军,曾东强 专利申请人 释科生物科技(广州)有限公司 专利代理人 杨虹坤;颜希文 专利代理机构 广州三环专利商标代理有限公司 ...